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技術(shù)文(wen)章
肌肉(rou)嫩度儀(yi):江口蘿卜豬(zhu)UCP3 基因變異(yi)及其表(biao)達(dá)量(liang)與肉質(zhì)(zhi)性狀關(guān)聯(lián)(lian)性分析
? ?2018年,貴州大學(xué)動(dong)物科(ke)學(xué)學(xué)院研究人員在國(guo)內(nèi)期(qi)刊《農(nóng)業(yè)生物(wu)技術(shù)學(xué)報》在線發(fā)表了題(ti)為“江口蘿卜(bo)豬UCP3 基因變(bian)異及其表(biao)達(dá)量與肉(rou)質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)(lian)性分析"的研究文(wen)章。在該(gai)論文中,研究人(ren)員使用上(shang)海騰(teng)拔儀器(qi)科技有限公司(si)的RTA-Meat肌肉嫩度儀(yi)來測定豬肉(rou)的剪切力(li)。
? 摘要:解耦聯(lián)蛋白3 (uncoupling protein 3, UCP3)作(zuo)為重要調(diào)控(kong)蛋白,主(zhu)要參與機(jī)體(ti)能量代謝調(diào)節(jié)(jie),在脂(zhi)質(zhì)代謝,脂肪(fang)酸氧化和脂(zhi)肪沉積中起著(zhe)重要作用(yong),對氧化磷酸(suan)化反應(yīng)途(tu)徑是否產(chǎn)生ATP起(qi)決定性(xing)作用。為(wei)研究UCP3 基因與(yu)豬肉質(zhì)性(xing)狀之間(jian)的關(guān)系,本研究(jiu)測定了(le)165 頭江口(kou)蘿卜豬(zhu)(Sus scrofa) 11 項肉質(zhì)(zhi)性能指標(biāo),利(li)用混合DNA池擴(kuò)增(zeng)UCP3 基因全部外顯(xian)子,測序篩(shai)選SNPs 位點(diǎn)(dian),用單(dan)個樣本DNA擴(kuò)增(zeng)SNPs 位點(diǎn)對(dui)應(yīng)外顯子并(bing)測序,以驗(yàn)(yan)證位(wei)點(diǎn)和(he)分型,分析(xi)各位(wei)點(diǎn)不同基因(yin)型江口蘿(luo)卜豬肉質(zhì)性能(neng)差異。采用(yong)qRTPCR檢測了(le)UCP3 基因在背最長(zhang)肌中的(de)表達(dá)量,進(jìn)行基(ji)因型、肉質(zhì)性(xing)能以及基因表(biao)達(dá)量的(de)相關(guān)性研究。研(yan)究結(jié)果發(fā)(fa)現(xiàn)了(le)6 個SNPs 位點(diǎn),g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群(qun)體遺傳參數(shù)分(fen)析發(fā)現(xiàn)除g.10479A>G/T位(wei)點(diǎn)外的(de)其他位點(diǎn)雜(za)合度高(gao),說明群體內(nèi)(nei)等位基因分布(bu)比較均勻;有(you)效等(deng)位基因(yin)數(shù)高,表明(ming)群體內(nèi)(nei)變異程度(du)大;多態(tài)信(xin)息含量(liang)均大于0.25,為中度(du)多態(tài),表明位(wei)點(diǎn)可以提(ti)供一定(ding)的遺(yi)傳信(xin)息。χ2檢驗(yàn)顯示(shi)6 個位點(diǎn)均極顯(xian)著偏離Hardy-Weinberg 平(ping)衡。連鎖不(bu)平衡分析發(fā)(fa)現(xiàn),g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位(wei)點(diǎn)、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位點(diǎn)為(wei)*連鎖不(bu)平衡,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間(jian)為強(qiáng)連鎖(suo)不平衡。SNPs 位點(diǎn)與(yu)肉質(zhì)的關(guān)聯(lián)性(xing)分析發(fā)現(xiàn)(xian)g.10479A>G/T位點(diǎn)TT型(xing)和GG型個體大(da)理石(shi)紋評(ping)分顯著(zhu)高于AA型(xing)和AG型個(ge)體,剪切力則反(fan)之;基因型(xing)與背最(zui)長肌中(zhong)UCP3 基因表達(dá)(da)量的(de)關(guān)聯(lián)(lian)性分(fen)析發(fā)(fa)現(xiàn),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T 4 個(ge)位點(diǎn)(dian)上均為突變型(xing)個體表達(dá)量(liang)極顯著(zhu)高于(yu)另外兩(liang)種基因(yin)型;UCP3 基因在背最(zui)長肌中的表(biao)達(dá)量與兩(liang)項肉質(zhì)(zhi)指標(biāo)(biao)存在(zai)極顯著相(xiang)關(guān)性,其中與(yu)剪切力負(fù)相關(guān)(guan),與肌內(nèi)脂(zhi)肪含(han)量正(zheng)相關(guān)(guan)。本研究(jiu)結(jié)果表明,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以(yi)及g.10479A>G/T位點(diǎn)為影(ying)響江口蘿卜豬(zhu)肉質(zhì)性能(neng)的重要SNPs位點(diǎn)(dian),且UCP3 基因表達(dá)量(liang)提高有(you)利于肌內(nèi)脂肪(fang)的沉積,此研(yan)究結(jié)(jie)果為篩選有助(zhu)于江口(kou)蘿卜豬肌內(nèi)脂(zhi)肪沉積(ji)的分子標(biāo)記(ji)提供了參考依(yi)據(jù)。
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