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肌肉嫩度儀(yi):江口蘿卜豬UCP3 基(ji)因變(bian)異及(ji)其表達(dá)量(liang)與肉質(zhì)(zhi)性狀關(guān)聯(lián)(lian)性分析
? ?2018年,貴州大學(xué)(xue)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院(yuan)研究人員在國(guó)(guo)內(nèi)期刊《農(nóng)業(yè)生物技術(shù)(shu)學(xué)報(bào)(bao)》在線發(fā)表(biao)了題為“江口蘿卜豬(zhu)UCP3 基因變異(yi)及其(qi)表達(dá)量(liang)與肉質(zhì)性狀關(guān)(guan)聯(lián)性分析"的研究文章。在(zai)該論文中,研(yan)究人員使(shi)用上(shang)海騰拔(ba)儀器(qi)科技有限公司(si)的RTA-Meat肌肉嫩度儀(yi)來(lái)測(cè)定豬肉的(de)剪切力(li)。
? 摘要:解耦(ou)聯(lián)蛋白(bai)3 (uncoupling protein 3, UCP3)作為(wei)重要調(diào)控蛋(dan)白,主要(yao)參與機(jī)體(ti)能量代謝(xie)調(diào)節(jié),在(zai)脂質(zhì)代(dai)謝,脂肪酸(suan)氧化和脂肪沉(chen)積中起著(zhe)重要作用(yong),對(duì)氧(yang)化磷酸(suan)化反應(yīng)途徑(jing)是否產(chǎn)生ATP起(qi)決定(ding)性作(zuo)用。為研究UCP3 基因(yin)與豬肉質(zhì)性狀(zhuang)之間(jian)的關(guān)系,本研(yan)究測(cè)(ce)定了165 頭江口蘿(luo)卜豬(zhu)(Sus scrofa) 11 項(xiàng)肉質(zhì)性能指(zhi)標(biāo),利用(yong)混合(he)DNA池?cái)U(kuò)增UCP3 基因全(quan)部外(wai)顯子,測(cè)(ce)序篩(shai)選SNPs 位點(diǎn),用(yong)單個(gè)(ge)樣本DNA擴(kuò)(kuo)增SNPs 位點(diǎn)對(duì)應(yīng)外(wai)顯子并測(cè)序,以(yi)驗(yàn)證(zheng)位點(diǎn)和分(fen)型,分析各(ge)位點(diǎn)不同(tong)基因(yin)型江口蘿卜(bo)豬肉質(zhì)性(xing)能差(cha)異。采用qRTPCR檢測(cè)(ce)了UCP3 基因在背(bei)最長(zhǎng)肌中的表(biao)達(dá)量,進(jìn)行基(ji)因型(xing)、肉質(zhì)(zhi)性能以(yi)及基(ji)因表達(dá)(da)量的相關(guān)性(xing)研究(jiu)。研究(jiu)結(jié)果發(fā)現(xiàn)了(le)6 個(gè)SNPs 位點(diǎn),g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群(qun)體遺傳參(can)數(shù)分析發(fā)現(xiàn)除(chu)g.10479A>G/T位點(diǎn)外的其(qi)他位點(diǎn)雜合(he)度高,說(shuō)(shuo)明群體(ti)內(nèi)等(deng)位基因分布(bu)比較(jiao)均勻;有效(xiao)等位基因(yin)數(shù)高,表(biao)明群體內(nèi)變(bian)異程度大;多(duo)態(tài)信息(xi)含量均大于0.25,為(wei)中度多態(tài),表明(ming)位點(diǎn)可以提(ti)供一定的遺傳(chuan)信息。χ2檢驗(yàn)(yan)顯示6 個(gè)位點(diǎn)(dian)均極顯著偏(pian)離Hardy-Weinberg 平衡。連鎖(suo)不平衡分(fen)析發(fā)現(xiàn),g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位點(diǎn)(dian)、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位點(diǎn)為(wei)*連鎖不平衡(heng),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間為強(qiáng)連(lian)鎖不平衡(heng)。SNPs 位點(diǎn)(dian)與肉質(zhì)的關(guān)聯(lián)(lian)性分析發(fā)現(xiàn)g.10479A>G/T位(wei)點(diǎn)TT型和GG型個(gè)體(ti)大理石紋評(píng)(ping)分顯著高于(yu)AA型和AG型個(gè)體,剪(jian)切力則反之(zhi);基因型與背(bei)最長(zhǎng)肌中UCP3 基因(yin)表達(dá)量(liang)的關(guān)聯(lián)性分析(xi)發(fā)現(xiàn),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T 4 個(gè)位(wei)點(diǎn)上均為(wei)突變型(xing)個(gè)體(ti)表達(dá)(da)量極顯著高于(yu)另外兩種(zhong)基因型;UCP3 基因在(zai)背最長(zhǎng)肌中(zhong)的表達(dá)量與兩(liang)項(xiàng)肉質(zhì)指標(biāo)(biao)存在(zai)極顯著(zhu)相關(guān)性,其(qi)中與(yu)剪切(qie)力負(fù)相關(guān)(guan),與肌內(nèi)(nei)脂肪含(han)量正相關(guān)(guan)。本研究(jiu)結(jié)果表明,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及(ji)g.10479A>G/T位點(diǎn)為(wei)影響江口蘿卜(bo)豬肉質(zhì)(zhi)性能的(de)重要(yao)SNPs位點(diǎn),且UCP3 基因表(biao)達(dá)量提高有利(li)于肌內(nèi)(nei)脂肪的沉積(ji),此研(yan)究結(jié)果為(wei)篩選(xuan)有助于江口蘿(luo)卜豬肌內(nèi)脂(zhi)肪沉(chen)積的分子標(biāo)記(ji)提供了參(can)考依據(jù)。
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