技術(shù)文章
Technical articles? ?2018年,貴州(zhou)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)(xue)學(xué)院研究(jiu)人員(yuan)在國內(nèi)期(qi)刊《農(nóng)業(yè)生物(wu)技術(shù)學(xué)報(bào)》在線(xian)發(fā)表了題(ti)為“江口蘿卜豬UCP3 基(ji)因變異及其(qi)表達(dá)量(liang)與肉質(zhì)性狀關(guān)(guan)聯(lián)性分析"的研究文(wen)章。在該(gai)論文中,研究(jiu)人員(yuan)使用上海騰拔(ba)儀器科技有(you)限公司的(de)RTA-Meat肌肉嫩度儀來(lai)測定豬肉的(de)剪切力。
? 摘要:解耦聯(lián)蛋白(bai)3 (uncoupling protein 3, UCP3)作為重要調(diào)(diao)控蛋白,主要參(can)與機(jī)體(ti)能量代(dai)謝調(diào)節(jié),在脂(zhi)質(zhì)代謝(xie),脂肪酸氧化和(he)脂肪沉(chen)積中起著(zhe)重要作用,對(dui)氧化磷酸化(hua)反應(yīng)途(tu)徑是(shi)否產(chǎn)生ATP起決(jue)定性作用(yong)。為研(yan)究UCP3 基因與(yu)豬肉質(zhì)性狀之(zhi)間的關(guān)系,本(ben)研究測定了(le)165 頭江口蘿卜(bo)豬(Sus scrofa) 11 項(xiàng)(xiang)肉質(zhì)性能(neng)指標(biāo),利(li)用混合DNA池(chi)擴(kuò)增UCP3 基因(yin)全部外顯子,測(ce)序篩(shai)選SNPs 位點(diǎn),用(yong)單個(gè)(ge)樣本DNA擴(kuò)(kuo)增SNPs 位(wei)點(diǎn)對應(yīng)外(wai)顯子并測序(xu),以驗(yàn)證位點(diǎn)(dian)和分型,分(fen)析各位點(diǎn)不(bu)同基因型(xing)江口蘿卜豬肉(rou)質(zhì)性能(neng)差異(yi)。采用qRTPCR檢測了UCP3 基(ji)因在(zai)背最(zui)長肌中的表(biao)達(dá)量,進(jìn)(jin)行基因型、肉質(zhì)(zhi)性能以及基因(yin)表達(dá)(da)量的(de)相關(guān)性研究。研(yan)究結(jié)果發(fā)現(xiàn)了(le)6 個(gè)SNPs 位點(diǎn),g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群體(ti)遺傳(chuan)參數(shù)分析發(fā)(fa)現(xiàn)除g.10479A>G/T位點(diǎn)(dian)外的(de)其他位點(diǎn)(dian)雜合(he)度高,說明群(qun)體內(nèi)等位(wei)基因分(fen)布比較均(jun)勻;有效(xiao)等位基因(yin)數(shù)高,表明群(qun)體內(nèi)(nei)變異(yi)程度大;多態(tài)(tai)信息含量均(jun)大于0.25,為中度(du)多態(tài),表明(ming)位點(diǎn)可以提供(gong)一定的遺傳信(xin)息。χ2檢驗(yàn)顯示6 個(gè)(ge)位點(diǎn)均極(ji)顯著偏離(li)Hardy-Weinberg 平衡。連鎖不(bu)平衡分析發(fā)(fa)現(xiàn),g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位點(diǎn)、g. 10439C>T 和(he)g. 10466G>A 位點(diǎn)(dian)為*連鎖(suo)不平衡,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間(jian)為強(qiáng)(qiang)連鎖不平衡。SNPs 位(wei)點(diǎn)與肉質(zhì)的關(guān)(guan)聯(lián)性分析(xi)發(fā)現(xiàn)g.10479A>G/T位點(diǎn)TT型(xing)和GG型個(gè)體(ti)大理石紋評分(fen)顯著高(gao)于AA型和AG型(xing)個(gè)體,剪切力(li)則反之;基因型(xing)與背最長肌(ji)中UCP3 基因表達(dá)量(liang)的關(guān)聯(lián)(lian)性分析發(fā)(fa)現(xiàn),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以(yi)及g.10479A>G/T 4 個(gè)(ge)位點(diǎn)上均為(wei)突變型個(gè)(ge)體表達(dá)(da)量極顯著高于(yu)另外兩種基因(yin)型;UCP3 基因在背最(zui)長肌中的表(biao)達(dá)量與(yu)兩項(xiàng)肉質(zhì)(zhi)指標(biāo)存在極(ji)顯著(zhu)相關(guān)性,其中與(yu)剪切(qie)力負(fù)相關(guān)(guan),與肌內(nèi)脂肪含(han)量正相關(guān)(guan)。本研(yan)究結(jié)果表(biao)明,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T位點(diǎn)為(wei)影響江(jiang)口蘿卜豬肉質(zhì)(zhi)性能的重要SNPs位(wei)點(diǎn),且UCP3 基因表(biao)達(dá)量提高有利(li)于肌(ji)內(nèi)脂肪的(de)沉積,此(ci)研究結(jié)果為(wei)篩選有助于(yu)江口蘿卜豬肌(ji)內(nèi)脂肪沉積(ji)的分子(zi)標(biāo)記提供了參(can)考依據(jù)。
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