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肌肉嫩度儀(yi):江口(kou)蘿卜豬UCP3 基因(yin)變異及(ji)其表達(dá)量(liang)與肉質(zhì)(zhi)性狀關(guān)聯(lián)(lian)性分析
? ?2018年,貴州大學(xué)動(dòng)(dong)物科學(xué)(xue)學(xué)院研究(jiu)人員在(zai)國(guó)內(nèi)期刊(kan)《農(nóng)業(yè)生物技術(shù)(shu)學(xué)報(bào)》在線發(fā)(fa)表了題(ti)為“江口(kou)蘿卜豬UCP3 基因變(bian)異及(ji)其表(biao)達(dá)量與肉(rou)質(zhì)性狀(zhuang)關(guān)聯(lián)性分(fen)析"的研究文章(zhang)。在該論文(wen)中,研究(jiu)人員(yuan)使用上海騰拔(ba)儀器(qi)科技有限公司(si)的RTA-Meat肌肉(rou)嫩度儀來測(cè)定(ding)豬肉的(de)剪切力。
? 摘要:解耦聯(lián)(lian)蛋白3 (uncoupling protein 3, UCP3)作為重要(yao)調(diào)控蛋白(bai),主要參與機(jī)體(ti)能量代謝調(diào)(diao)節(jié),在脂質(zhì)代謝(xie),脂肪酸(suan)氧化和脂(zhi)肪沉積中起(qi)著重要作(zuo)用,對(duì)(dui)氧化磷(lin)酸化反應(yīng)途(tu)徑是否產(chǎn)生ATP起(qi)決定性(xing)作用。為研究(jiu)UCP3 基因與豬肉(rou)質(zhì)性狀(zhuang)之間(jian)的關(guān)(guan)系,本(ben)研究測(cè)(ce)定了(le)165 頭江(jiang)口蘿卜豬(Sus scrofa) 11 項(xiàng)肉(rou)質(zhì)性(xing)能指標(biāo),利(li)用混(hun)合DNA池(chi)擴(kuò)增UCP3 基因(yin)全部(bu)外顯(xian)子,測(cè)序篩選SNPs 位(wei)點(diǎn),用(yong)單個(gè)樣(yang)本DNA擴(kuò)增(zeng)SNPs 位點(diǎn)對(duì)應(yīng)外顯(xian)子并(bing)測(cè)序,以驗(yàn)(yan)證位點(diǎn)和分型(xing),分析各位點(diǎn)不(bu)同基(ji)因型江口蘿卜(bo)豬肉(rou)質(zhì)性能差(cha)異。采(cai)用qRTPCR檢測(cè)了(le)UCP3 基因在背最長(zhǎng)(zhang)肌中(zhong)的表達(dá)(da)量,進(jìn)行基因(yin)型、肉質(zhì)(zhi)性能(neng)以及基因表達(dá)(da)量的相關(guān)(guan)性研(yan)究。研究結(jié)(jie)果發(fā)(fa)現(xiàn)了6 個(gè)SNPs 位(wei)點(diǎn),g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群體遺(yi)傳參數(shù)分(fen)析發(fā)現(xiàn)除(chu)g.10479A>G/T位點(diǎn)外的(de)其他位(wei)點(diǎn)雜合度高,說(shuo)明群體內(nèi)(nei)等位(wei)基因分(fen)布比較均勻;有(you)效等位基(ji)因數(shù)高,表明群(qun)體內(nèi)變異程(cheng)度大;多態(tài)(tai)信息含量(liang)均大于0.25,為中(zhong)度多態(tài)(tai),表明位點(diǎn)可(ke)以提供一定(ding)的遺傳信(xin)息。χ2檢驗(yàn)顯(xian)示6 個(gè)(ge)位點(diǎn)均極(ji)顯著(zhu)偏離Hardy-Weinberg 平衡。連鎖(suo)不平衡分(fen)析發(fā)(fa)現(xiàn),g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位點(diǎn)(dian)、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位(wei)點(diǎn)為*連鎖(suo)不平衡,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間為(wei)強(qiáng)連鎖不平(ping)衡。SNPs 位(wei)點(diǎn)與肉(rou)質(zhì)的關(guān)聯(lián)性(xing)分析發(fā)現(xiàn)(xian)g.10479A>G/T位點(diǎn)TT型和GG型(xing)個(gè)體大理石(shi)紋評(píng)分顯(xian)著高于AA型和(he)AG型個(gè)體,剪切(qie)力則反之(zhi);基因型與(yu)背最長(zhǎng)肌中UCP3 基(ji)因表(biao)達(dá)量(liang)的關(guān)聯(lián)性分析(xi)發(fā)現(xiàn),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T 4 個(gè)位(wei)點(diǎn)上均(jun)為突變型個(gè)體(ti)表達(dá)量極顯(xian)著高于另外(wai)兩種(zhong)基因型(xing);UCP3 基因在背(bei)最長(zhǎng)肌中(zhong)的表達(dá)量與(yu)兩項(xiàng)肉質(zhì)指(zhi)標(biāo)存在(zai)極顯著(zhu)相關(guān)性,其中(zhong)與剪切力負(fù)(fu)相關(guān),與(yu)肌內(nèi)脂肪(fang)含量正相關(guān)。本(ben)研究結(jié)(jie)果表明,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以(yi)及g.10479A>G/T位點(diǎn)(dian)為影(ying)響江口蘿卜(bo)豬肉質(zhì)性能的(de)重要(yao)SNPs位點(diǎn),且UCP3 基因表(biao)達(dá)量提(ti)高有(you)利于肌(ji)內(nèi)脂肪的沉積(ji),此研究(jiu)結(jié)果為(wei)篩選有助于江(jiang)口蘿卜豬肌(ji)內(nèi)脂肪沉(chen)積的(de)分子標(biāo)記提(ti)供了參考依據(jù)(ju)。
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