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技術(shù)文章(zhang)
肌肉嫩度(du)儀:江口蘿卜豬(zhu)UCP3 基因變異及(ji)其表達量與肉(rou)質(zhì)性狀關(guān)(guan)聯(lián)性分析
? ?2018年,貴州大(da)學動物科學學(xue)院研究人(ren)員在國(guo)內(nèi)期刊《農(nóng)業(yè)生物(wu)技術(shù)學報》在線(xian)發(fā)表了題為“江口蘿卜豬(zhu)UCP3 基因變異及(ji)其表(biao)達量與肉質(zhì)性(xing)狀關(guān)(guan)聯(lián)性分(fen)析"的研究文章(zhang)。在該(gai)論文中,研(yan)究人員(yuan)使用上海(hai)騰拔儀器科(ke)技有限(xian)公司的RTA-Meat肌(ji)肉嫩(nen)度儀來測定(ding)豬肉的剪切力(li)。
? 摘要(yao):解耦聯(lián)蛋白(bai)3 (uncoupling protein 3, UCP3)作為(wei)重要(yao)調(diào)控蛋白,主(zhu)要參與機體能(neng)量代謝(xie)調(diào)節(jié)(jie),在脂質(zhì)代(dai)謝,脂肪(fang)酸氧(yang)化和脂肪(fang)沉積中起著(zhe)重要作用,對氧(yang)化磷(lin)酸化反應途(tu)徑是否產(chǎn)生(sheng)ATP起決定性作用(yong)。為研究UCP3 基因(yin)與豬肉質(zhì)性(xing)狀之間的(de)關(guān)系,本研究測(ce)定了165 頭江(jiang)口蘿卜豬(Sus scrofa) 11 項(xiang)肉質(zhì)性能指(zhi)標,利用(yong)混合DNA池(chi)擴增UCP3 基因全(quan)部外顯子(zi),測序篩(shai)選SNPs 位點,用單(dan)個樣(yang)本DNA擴增SNPs 位點(dian)對應外顯子并(bing)測序,以驗(yan)證位點和分型(xing),分析各位點(dian)不同(tong)基因型(xing)江口蘿卜豬(zhu)肉質(zhì)性能差(cha)異。采用qRTPCR檢測(ce)了UCP3 基因在背最(zui)長肌中的(de)表達量,進行基(ji)因型、肉(rou)質(zhì)性能以及(ji)基因(yin)表達(da)量的相關(guān)(guan)性研究。研(yan)究結(jié)果發(fā)現(xiàn)(xian)了6 個SNPs 位點(dian),g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群體遺傳參數(shù)(shu)分析發(fā)(fa)現(xiàn)除g.10479A>G/T位(wei)點外的(de)其他位點雜合(he)度高,說明群(qun)體內(nèi)等位基(ji)因分(fen)布比較(jiao)均勻;有效等位(wei)基因數(shù)(shu)高,表明群體(ti)內(nèi)變(bian)異程度(du)大;多態(tài)(tai)信息含量均(jun)大于0.25,為(wei)中度多態(tài),表(biao)明位點可(ke)以提供一定的(de)遺傳信(xin)息。χ2檢驗顯示(shi)6 個位點均極顯(xian)著偏離Hardy-Weinberg 平衡。連(lian)鎖不平衡(heng)分析(xi)發(fā)現(xiàn),g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位點(dian)、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位點(dian)為*連鎖不(bu)平衡,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間為(wei)強連鎖(suo)不平衡(heng)。SNPs 位點與肉(rou)質(zhì)的關(guān)(guan)聯(lián)性分析(xi)發(fā)現(xiàn)g.10479A>G/T位點(dian)TT型和GG型個(ge)體大理(li)石紋評分顯(xian)著高于(yu)AA型和AG型(xing)個體,剪切力則(ze)反之;基因型與(yu)背最(zui)長肌中UCP3 基因(yin)表達(da)量的關(guān)聯(lián)性分(fen)析發(fā)現(xiàn),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T 4 個(ge)位點上均為突(tu)變型個(ge)體表達量極顯(xian)著高于另外兩(liang)種基因(yin)型;UCP3 基因(yin)在背最長(zhang)肌中的(de)表達(da)量與兩項肉質(zhì)(zhi)指標存(cun)在極(ji)顯著相關(guān)性(xing),其中(zhong)與剪切力負相(xiang)關(guān),與肌內(nèi)(nei)脂肪含量正(zheng)相關(guān)。本(ben)研究結(jié)果表明(ming),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及(ji)g.10479A>G/T位點為影(ying)響江(jiang)口蘿卜(bo)豬肉質(zhì)性能(neng)的重要SNPs位點,且(qie)UCP3 基因表達量(liang)提高有利于(yu)肌內(nèi)脂肪的(de)沉積(ji),此研(yan)究結(jié)(jie)果為篩選(xuan)有助于江口(kou)蘿卜(bo)豬肌內(nèi)脂肪沉(chen)積的分子標(biao)記提供了參考(kao)依據(jù)。
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