技術(shù)(shu)文章
Technical articles? ?2018年,貴州(zhou)大學(xué)動物科(ke)學(xué)學(xué)院(yuan)研究人(ren)員在國內(nèi)期(qi)刊《農(nóng)業(yè)(ye)生物技術(shù)(shu)學(xué)報》在線發(fā)表(biao)了題為“江口(kou)蘿卜豬(zhu)UCP3 基因變異及其(qi)表達量與肉(rou)質(zhì)性狀(zhuang)關(guān)聯(lián)性分析(xi)"的研究(jiu)文章。在該論(lun)文中,研究人員(yuan)使用(yong)上海騰拔儀器(qi)科技有(you)限公司的RTA-Meat肌(ji)肉嫩度儀來測(ce)定豬肉的剪切(qie)力。
? 摘要:解耦聯(lián)蛋白3 (uncoupling protein 3, UCP3)作(zuo)為重要調(diào)(diao)控蛋白,主要參(can)與機體(ti)能量(liang)代謝調(diào)節(jié),在(zai)脂質(zhì)代謝(xie),脂肪酸氧化和(he)脂肪(fang)沉積中起(qi)著重要作(zuo)用,對(dui)氧化磷酸(suan)化反應(yīng)途徑是(shi)否產(chǎn)(chan)生ATP起決定(ding)性作用。為研究(jiu)UCP3 基因與豬肉質(zhì)(zhi)性狀之間的(de)關(guān)系,本(ben)研究測定了165 頭(tou)江口(kou)蘿卜豬(Sus scrofa) 11 項(xiang)肉質(zhì)性(xing)能指標(biao),利用混合DNA池擴(kuo)增UCP3 基因全部外(wai)顯子,測序篩選(xuan)SNPs 位點,用(yong)單個(ge)樣本DNA擴(kuo)增SNPs 位點對(dui)應(yīng)外顯子并測(ce)序,以驗證位點(dian)和分型,分(fen)析各位(wei)點不同基因型(xing)江口蘿卜豬(zhu)肉質(zhì)(zhi)性能差(cha)異。采(cai)用qRTPCR檢測了UCP3 基因(yin)在背(bei)最長肌中的(de)表達量(liang),進行(xing)基因型、肉(rou)質(zhì)性能以(yi)及基(ji)因表達(da)量的相關(guān)性研(yan)究。研究結(jié)果(guo)發(fā)現(xiàn)了6 個(ge)SNPs 位點(dian),g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群體(ti)遺傳參數(shù)分(fen)析發(fā)現(xiàn)除(chu)g.10479A>G/T位點(dian)外的其他位(wei)點雜合度高(gao),說明(ming)群體內(nèi)等(deng)位基因(yin)分布比較(jiao)均勻;有效等位(wei)基因數(shù)高(gao),表明群體(ti)內(nèi)變(bian)異程度大;多(duo)態(tài)信息含量均(jun)大于0.25,為中度(du)多態(tài),表明(ming)位點可(ke)以提供(gong)一定的遺傳(chuan)信息。χ2檢驗顯(xian)示6 個位(wei)點均極(ji)顯著偏離Hardy-Weinberg 平衡(heng)。連鎖不(bu)平衡分析(xi)發(fā)現(xiàn),g. 3127A>G 和(he)g. 3205T>C 位點、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位(wei)點為(wei)*連鎖(suo)不平衡,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間為(wei)強連鎖不(bu)平衡。SNPs 位點與肉(rou)質(zhì)的(de)關(guān)聯(lián)性分析(xi)發(fā)現(xiàn)g.10479A>G/T位(wei)點TT型(xing)和GG型個體(ti)大理石紋(wen)評分顯著(zhu)高于AA型和(he)AG型個體,剪切(qie)力則反(fan)之;基因(yin)型與背(bei)最長肌中UCP3 基因(yin)表達量的(de)關(guān)聯(lián)性分(fen)析發(fā)現(xiàn),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T 4 個(ge)位點上均為(wei)突變型個(ge)體表達量極顯(xian)著高于另(ling)外兩種基(ji)因型(xing);UCP3 基因在(zai)背最長肌(ji)中的表達量(liang)與兩項(xiang)肉質(zhì)指標存(cun)在極顯著相關(guān)(guan)性,其中與(yu)剪切(qie)力負(fu)相關(guān),與肌內(nèi)(nei)脂肪含量正相(xiang)關(guān)。本研究結(jié)果(guo)表明,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及(ji)g.10479A>G/T位點為影響(xiang)江口蘿卜豬肉(rou)質(zhì)性(xing)能的重(zhong)要SNPs位點(dian),且UCP3 基因表達(da)量提(ti)高有利(li)于肌內(nèi)(nei)脂肪的沉積,此(ci)研究(jiu)結(jié)果為(wei)篩選(xuan)有助于江(jiang)口蘿卜豬肌(ji)內(nèi)脂(zhi)肪沉積的(de)分子標(biao)記提(ti)供了(le)參考依(yi)據(jù)。
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