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肌肉(rou)嫩度(du)儀:江口蘿卜豬(zhu)UCP3 基因變異及(ji)其表達(dá)量與(yu)肉質(zhì)(zhi)性狀關(guān)聯(lián)性分(fen)析
? ?2018年,貴州大學(xué)動物(wu)科學(xué)學(xué)院研究人員(yuan)在國(guo)內(nèi)期刊《農(nóng)業(yè)生(sheng)物技(ji)術(shù)學(xué)報》在線發(fā)(fa)表了題為“江口(kou)蘿卜(bo)豬UCP3 基(ji)因變異及(ji)其表(biao)達(dá)量與(yu)肉質(zhì)性狀(zhuang)關(guān)聯(lián)性分析"的研究文(wen)章。在該論文(wen)中,研究人員(yuan)使用上(shang)海騰拔(ba)儀器科(ke)技有限公司的(de)RTA-Meat肌肉嫩度儀(yi)來測定豬肉(rou)的剪(jian)切力(li)。
? 摘要(yao):解耦聯(lián)蛋白3 (uncoupling protein 3, UCP3)作(zuo)為重要調(diào)控蛋(dan)白,主要(yao)參與機(jī)體(ti)能量代(dai)謝調(diào)(diao)節(jié),在脂(zhi)質(zhì)代謝,脂(zhi)肪酸氧化和(he)脂肪沉積(ji)中起著重要(yao)作用,對(dui)氧化(hua)磷酸化反應(yīng)(ying)途徑是否產(chǎn)(chan)生ATP起決定(ding)性作用。為研(yan)究UCP3 基因與(yu)豬肉質(zhì)(zhi)性狀之間的關(guān)(guan)系,本(ben)研究測(ce)定了165 頭江口蘿(luo)卜豬(Sus scrofa) 11 項肉質(zhì)(zhi)性能指標(biāo),利(li)用混合(he)DNA池擴(kuò)增UCP3 基因全(quan)部外顯子,測(ce)序篩選SNPs 位點,用(yong)單個樣本DNA擴(kuò)(kuo)增SNPs 位點(dian)對應(yīng)外顯子(zi)并測序(xu),以驗(yan)證位(wei)點和分型,分(fen)析各位點不(bu)同基因型江口(kou)蘿卜豬(zhu)肉質(zhì)性(xing)能差異。采(cai)用qRTPCR檢(jian)測了UCP3 基因在背(bei)最長(zhang)肌中的表達(dá)(da)量,進(jìn)行(xing)基因型、肉質(zhì)(zhi)性能以(yi)及基因(yin)表達(dá)(da)量的相(xiang)關(guān)性研究。研究(jiu)結(jié)果發(fā)現(xiàn)了(le)6 個SNPs 位點,g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群體遺(yi)傳參(can)數(shù)分析(xi)發(fā)現(xiàn)除g.10479A>G/T位(wei)點外的其他位(wei)點雜(za)合度高,說明(ming)群體內(nèi)等位(wei)基因分布比較(jiao)均勻;有效等位(wei)基因數(shù)(shu)高,表明群體(ti)內(nèi)變異程度(du)大;多態(tài)(tai)信息含量均大(da)于0.25,為中度(du)多態(tài),表明位點(dian)可以提供(gong)一定的遺(yi)傳信息。χ2檢(jian)驗顯示6 個位點(dian)均極顯著(zhu)偏離Hardy-Weinberg 平衡。連鎖(suo)不平衡分析發(fā)(fa)現(xiàn),g. 3127A>G 和(he)g. 3205T>C 位點、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位點為(wei)*連鎖不平衡,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之(zhi)間為強連鎖不(bu)平衡。SNPs 位(wei)點與肉(rou)質(zhì)的關(guān)聯(lián)性分(fen)析發(fā)現(xiàn)(xian)g.10479A>G/T位點TT型和GG型個(ge)體大理石(shi)紋評分顯著(zhu)高于AA型和AG型(xing)個體,剪切力則(ze)反之(zhi);基因型與(yu)背最長肌中(zhong)UCP3 基因表達(dá)(da)量的關(guān)聯(lián)(lian)性分(fen)析發(fā)現(xiàn),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T 4 個(ge)位點上均為(wei)突變(bian)型個體表達(dá)(da)量極(ji)顯著高于(yu)另外兩種(zhong)基因(yin)型;UCP3 基(ji)因在(zai)背最長(zhang)肌中(zhong)的表達(dá)(da)量與兩項(xiang)肉質(zhì)指標(biāo)(biao)存在極(ji)顯著(zhu)相關(guān)(guan)性,其(qi)中與剪切力負(fù)(fu)相關(guān),與肌(ji)內(nèi)脂肪(fang)含量正相關(guān)。本(ben)研究結(jié)果(guo)表明,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及(ji)g.10479A>G/T位點(dian)為影響江口蘿(luo)卜豬肉質(zhì)性能(neng)的重要(yao)SNPs位點,且UCP3 基因表(biao)達(dá)量提(ti)高有(you)利于(yu)肌內(nèi)脂肪(fang)的沉積,此研(yan)究結(jié)(jie)果為(wei)篩選有助于江(jiang)口蘿卜豬肌(ji)內(nèi)脂肪(fang)沉積的分子標(biāo)(biao)記提供了(le)參考(kao)依據(jù)(ju)。
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