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肌肉嫩度(du)儀:江口蘿(luo)卜豬UCP3 基因(yin)變異(yi)及其(qi)表達(dá)量與肉(rou)質(zhì)性(xing)狀關(guān)聯(lián)性分析(xi)
? ?2018年,貴州大(da)學(xué)動(dòng)(dong)物科(ke)學(xué)學(xué)院(yuan)研究(jiu)人員在國(guó)內(nèi)期(qi)刊《農(nóng)業(yè)生物技術(shù)(shu)學(xué)報(bào)》在線(xian)發(fā)表了題為“江口蘿(luo)卜豬UCP3 基因變(bian)異及其表(biao)達(dá)量與肉質(zhì)(zhi)性狀關(guān)聯(lián)性分(fen)析"的研究文章(zhang)。在該論文中,研(yan)究人員使用(yong)上海騰拔儀器(qi)科技有限(xian)公司(si)的RTA-Meat肌肉嫩度儀(yi)來(lái)測(cè)定(ding)豬肉(rou)的剪切力。
? 摘要:解耦聯(lián)(lian)蛋白(bai)3 (uncoupling protein 3, UCP3)作為(wei)重要調(diào)控蛋(dan)白,主要(yao)參與機(jī)體能(neng)量代謝調(diào)節(jié),在(zai)脂質(zhì)代謝,脂(zhi)肪酸(suan)氧化(hua)和脂肪沉積中(zhong)起著重要作(zuo)用,對(duì)氧(yang)化磷酸化反(fan)應(yīng)途徑是(shi)否產(chǎn)(chan)生ATP起決定性(xing)作用。為研(yan)究UCP3 基因與(yu)豬肉質(zhì)性狀(zhuang)之間的(de)關(guān)系,本研究(jiu)測(cè)定了165 頭(tou)江口蘿(luo)卜豬(Sus scrofa) 11 項(xiàng)肉(rou)質(zhì)性能指(zhi)標(biāo),利(li)用混(hun)合DNA池?cái)U(kuò)增UCP3 基(ji)因全部外顯(xian)子,測(cè)序(xu)篩選SNPs 位點(diǎn),用(yong)單個(gè)樣本(ben)DNA擴(kuò)增SNPs 位點(diǎn)(dian)對(duì)應(yīng)外顯(xian)子并測(cè)序(xu),以驗(yàn)證位(wei)點(diǎn)和(he)分型(xing),分析(xi)各位點(diǎn)不(bu)同基因(yin)型江口(kou)蘿卜豬肉質(zhì)(zhi)性能差異。采用(yong)qRTPCR檢測(cè)了(le)UCP3 基因(yin)在背最長(zhǎng)肌中(zhong)的表達(dá)量,進(jìn)(jin)行基因型、肉質(zhì)(zhi)性能以及基因(yin)表達(dá)量(liang)的相(xiang)關(guān)性研究。研究(jiu)結(jié)果發(fā)現(xiàn)了(le)6 個(gè)SNPs 位點(diǎn),g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群體(ti)遺傳參(can)數(shù)分(fen)析發(fā)現(xiàn)除(chu)g.10479A>G/T位點(diǎn)外的其他(ta)位點(diǎn)雜合度高(gao),說(shuō)明群(qun)體內(nèi)等位基(ji)因分布比較均(jun)勻;有效等位(wei)基因數(shù)高,表(biao)明群體內(nèi)(nei)變異程(cheng)度大;多態(tài)信息(xi)含量均(jun)大于0.25,為中(zhong)度多(duo)態(tài),表(biao)明位點(diǎn)可(ke)以提供一定的(de)遺傳信息。χ2檢(jian)驗(yàn)顯示6 個(gè)位(wei)點(diǎn)均極顯(xian)著偏離Hardy-Weinberg 平(ping)衡。連鎖不(bu)平衡(heng)分析(xi)發(fā)現(xiàn),g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位(wei)點(diǎn)、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位點(diǎn)為(wei)*連鎖不(bu)平衡(heng),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間為強(qiáng)連鎖(suo)不平衡。SNPs 位(wei)點(diǎn)與肉質(zhì)的關(guān)(guan)聯(lián)性分析發(fā)(fa)現(xiàn)g.10479A>G/T位點(diǎn)TT型(xing)和GG型個(gè)體大理(li)石紋評(píng)分(fen)顯著高于(yu)AA型和(he)AG型個(gè)體,剪切(qie)力則反(fan)之;基因(yin)型與背最長(zhǎng)肌(ji)中UCP3 基因表達(dá)量(liang)的關(guān)聯(lián)性(xing)分析發(fā)現(xiàn),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以(yi)及g.10479A>G/T 4 個(gè)(ge)位點(diǎn)(dian)上均為(wei)突變(bian)型個(gè)(ge)體表達(dá)(da)量極(ji)顯著高于另(ling)外兩種基(ji)因型(xing);UCP3 基因在背(bei)最長(zhǎng)肌中的表(biao)達(dá)量與(yu)兩項(xiàng)肉質(zhì)(zhi)指標(biāo)存(cun)在極顯著相(xiang)關(guān)性,其中(zhong)與剪切力負(fù)(fu)相關(guān),與(yu)肌內(nèi)脂肪(fang)含量(liang)正相關(guān)。本研(yan)究結(jié)(jie)果表明,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以(yi)及g.10479A>G/T位點(diǎn)為影(ying)響江口(kou)蘿卜豬肉質(zhì)(zhi)性能的重要(yao)SNPs位點(diǎn),且UCP3 基因(yin)表達(dá)量提(ti)高有利(li)于肌(ji)內(nèi)脂肪的沉(chen)積,此研究(jiu)結(jié)果為篩選(xuan)有助于江口(kou)蘿卜(bo)豬肌內(nèi)脂肪(fang)沉積(ji)的分子標(biāo)記提(ti)供了參考(kao)依據(jù)。
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