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肌肉(rou)嫩度儀(yi):江口蘿卜豬UCP3 基(ji)因變異及(ji)其表達(dá)量與肉(rou)質(zhì)性狀關(guān)(guan)聯(lián)性分析
? ?2018年,貴州大學(xué)動物(wu)科學(xué)學(xué)院(yuan)研究人(ren)員在(zai)國內(nèi)期刊《農(nóng)業(yè)生物技(ji)術(shù)學(xué)報(bao)》在線發(fā)表了題(ti)為“江口蘿(luo)卜豬UCP3 基(ji)因變異(yi)及其表達(dá)量(liang)與肉(rou)質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)性(xing)分析(xi)"的研究文(wen)章。在(zai)該論文中,研(yan)究人員使用上(shang)海騰拔儀器科(ke)技有限(xian)公司的RTA-Meat肌肉嫩(nen)度儀來測(ce)定豬肉的(de)剪切力。
? 摘要(yao):解耦聯(lián)蛋(dan)白3 (uncoupling protein 3, UCP3)作為重要(yao)調(diào)控(kong)蛋白,主要(yao)參與機(jī)(ji)體能(neng)量代謝(xie)調(diào)節(jié),在脂(zhi)質(zhì)代謝(xie),脂肪酸氧化和(he)脂肪沉積中(zhong)起著重要作(zuo)用,對(dui)氧化磷酸化反(fan)應(yīng)途徑是否產(chǎn)(chan)生ATP起(qi)決定性(xing)作用。為研究(jiu)UCP3 基因與豬(zhu)肉質(zhì)性狀之間(jian)的關(guān)系,本研(yan)究測定了165 頭(tou)江口蘿卜(bo)豬(Sus scrofa) 11 項(xiàng)肉質(zhì)性(xing)能指標(biāo),利(li)用混合DNA池擴(kuò)增(zeng)UCP3 基因全部外(wai)顯子(zi),測序篩選SNPs 位(wei)點(diǎn),用單個樣(yang)本DNA擴(kuò)(kuo)增SNPs 位點(diǎn)(dian)對應(yīng)外顯子并(bing)測序,以驗(yàn)證(zheng)位點(diǎn)和分型,分(fen)析各(ge)位點(diǎn)(dian)不同基因型(xing)江口蘿卜豬(zhu)肉質(zhì)性(xing)能差異(yi)。采用qRTPCR檢測(ce)了UCP3 基(ji)因在背(bei)最長(zhang)肌中的表達(dá)(da)量,進(jìn)行基因(yin)型、肉(rou)質(zhì)性(xing)能以及基因表(biao)達(dá)量的(de)相關(guān)(guan)性研(yan)究。研究(jiu)結(jié)果(guo)發(fā)現(xiàn)了6 個SNPs 位點(diǎn)(dian),g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群體遺傳參(can)數(shù)分析(xi)發(fā)現(xiàn)除g.10479A>G/T位點(diǎn)外(wai)的其他(ta)位點(diǎn)雜合(he)度高(gao),說明群體(ti)內(nèi)等位基因分(fen)布比較均勻;有(you)效等(deng)位基因數(shù)高(gao),表明群體內(nèi)(nei)變異程(cheng)度大;多態(tài)信(xin)息含量均大于(yu)0.25,為中度多態(tài)(tai),表明位(wei)點(diǎn)可以提供一(yi)定的遺傳信息(xi)。χ2檢驗(yàn)顯(xian)示6 個位點(diǎn)均極(ji)顯著偏離Hardy-Weinberg 平衡(heng)。連鎖不平衡(heng)分析發(fā)現(xiàn)(xian),g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位(wei)點(diǎn)、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位(wei)點(diǎn)為(wei)*連鎖不(bu)平衡,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間(jian)為強(qiáng)連鎖不平(ping)衡。SNPs 位點(diǎn)與肉(rou)質(zhì)的關(guān)聯(lián)性分(fen)析發(fā)現(xiàn)(xian)g.10479A>G/T位點(diǎn)TT型和GG型(xing)個體(ti)大理石(shi)紋評(ping)分顯著(zhu)高于AA型(xing)和AG型個(ge)體,剪切(qie)力則反之;基因(yin)型與背最(zui)長肌(ji)中UCP3 基(ji)因表達(dá)量的(de)關(guān)聯(lián)性(xing)分析發(fā)現(xiàn)(xian),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T 4 個位點(diǎn)(dian)上均為突變型(xing)個體表達(dá)量極(ji)顯著(zhu)高于(yu)另外(wai)兩種基因型(xing);UCP3 基因在背最長(zhang)肌中(zhong)的表(biao)達(dá)量與(yu)兩項(xiàng)肉質(zhì)指(zhi)標(biāo)存在極(ji)顯著相關(guān)性(xing),其中與(yu)剪切(qie)力負(fù)相(xiang)關(guān),與肌內(nèi)脂肪(fang)含量(liang)正相(xiang)關(guān)。本研究(jiu)結(jié)果(guo)表明,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以(yi)及g.10479A>G/T位點(diǎn)(dian)為影響(xiang)江口蘿卜(bo)豬肉質(zhì)性(xing)能的重要SNPs位(wei)點(diǎn),且UCP3 基因表(biao)達(dá)量提高有利(li)于肌內(nèi)脂肪(fang)的沉(chen)積,此研究(jiu)結(jié)果為篩(shai)選有助于江(jiang)口蘿(luo)卜豬(zhu)肌內(nèi)脂(zhi)肪沉積的(de)分子標(biāo)記提(ti)供了(le)參考依據(jù)。
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