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肌肉嫩(nen)度儀:江口(kou)蘿卜豬UCP3 基因(yin)變異(yi)及其表達(dá)量(liang)與肉質(zhì)性狀關(guān)(guan)聯(lián)性分析
? ?2018年,貴州大學(xué)動(dòng)(dong)物科學(xué)學(xué)(xue)院研究人(ren)員在國內(nèi)(nei)期刊《農(nóng)業(yè)(ye)生物技(ji)術(shù)學(xué)報(bào)》在線發(fā)表了題(ti)為“江口蘿(luo)卜豬(zhu)UCP3 基因變異及其(qi)表達(dá)量與(yu)肉質(zhì)性(xing)狀關(guān)聯(lián)性(xing)分析"的研究文章(zhang)。在該(gai)論文(wen)中,研究人員使(shi)用上海(hai)騰拔儀器(qi)科技有限公(gong)司的RTA-Meat肌(ji)肉嫩度(du)儀來(lai)測定豬肉(rou)的剪(jian)切力。
? 摘要:解耦(ou)聯(lián)蛋白3 (uncoupling protein 3, UCP3)作為重(zhong)要調(diào)控(kong)蛋白,主要參(can)與機(jī)體能量代(dai)謝調(diào)節(jié),在脂(zhi)質(zhì)代謝,脂(zhi)肪酸氧化和(he)脂肪沉積中起(qi)著重要作用,對(dui)氧化磷酸化反(fan)應(yīng)途(tu)徑是否產(chǎn)(chan)生ATP起決定性作(zuo)用。為(wei)研究UCP3 基因與豬(zhu)肉質(zhì)性(xing)狀之間的關(guān)系(xi),本研究測定(ding)了165 頭(tou)江口蘿卜(bo)豬(Sus scrofa) 11 項(xiàng)肉(rou)質(zhì)性能(neng)指標(biāo),利用混合(he)DNA池?cái)U(kuò)增(zeng)UCP3 基因全(quan)部外顯子,測(ce)序篩選SNPs 位點(diǎn)(dian),用單個(gè)(ge)樣本DNA擴(kuò)增SNPs 位(wei)點(diǎn)對應(yīng)外顯(xian)子并測序(xu),以驗(yàn)證位(wei)點(diǎn)和分型,分(fen)析各位(wei)點(diǎn)不同基因型(xing)江口蘿卜(bo)豬肉質(zhì)性能差(cha)異。采用qRTPCR檢測(ce)了UCP3 基因在背(bei)最長(zhang)肌中(zhong)的表達(dá)量,進(jìn)(jin)行基(ji)因型、肉質(zhì)(zhi)性能以及基(ji)因表達(dá)量的(de)相關(guān)性研究。研(yan)究結(jié)果發(fā)(fa)現(xiàn)了6 個(gè)(ge)SNPs 位點(diǎn),g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群(qun)體遺傳參數(shù)分(fen)析發(fā)(fa)現(xiàn)除(chu)g.10479A>G/T位點(diǎn)外的(de)其他(ta)位點(diǎn)雜合度(du)高,說明群體內(nèi)(nei)等位基因分(fen)布比較均勻(yun);有效等位基(ji)因數(shù)高,表明(ming)群體內(nèi)(nei)變異程(cheng)度大;多態(tài)信息(xi)含量均(jun)大于0.25,為(wei)中度(du)多態(tài),表(biao)明位(wei)點(diǎn)可以提供一(yi)定的遺(yi)傳信息(xi)。χ2檢驗(yàn)顯示6 個(gè)(ge)位點(diǎn)均(jun)極顯著(zhu)偏離Hardy-Weinberg 平(ping)衡。連鎖不平(ping)衡分(fen)析發(fā)現(xiàn),g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位點(diǎn)(dian)、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位點(diǎn)為*連鎖(suo)不平衡,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間為(wei)強(qiáng)連鎖(suo)不平(ping)衡。SNPs 位點(diǎn)(dian)與肉質(zhì)的關(guān)聯(lián)(lian)性分(fen)析發(fā)現(xiàn)(xian)g.10479A>G/T位點(diǎn)TT型和(he)GG型個(gè)體大理石(shi)紋評(ping)分顯著高(gao)于AA型和AG型個(gè)(ge)體,剪(jian)切力則反之(zhi);基因(yin)型與背最(zui)長肌(ji)中UCP3 基(ji)因表達(dá)量的關(guān)(guan)聯(lián)性(xing)分析發(fā)現(xiàn),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以(yi)及g.10479A>G/T 4 個(gè)位點(diǎn)(dian)上均為突變型(xing)個(gè)體表達(dá)量(liang)極顯著高于(yu)另外兩種(zhong)基因(yin)型;UCP3 基因在背最(zui)長肌中的表達(dá)(da)量與兩項(xiàng)肉質(zhì)(zhi)指標(biāo)存在極顯(xian)著相關(guān)(guan)性,其中與剪(jian)切力負(fù)(fu)相關(guān),與肌內(nèi)(nei)脂肪含量正(zheng)相關(guān)。本研究(jiu)結(jié)果表明(ming),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T位點(diǎn)為(wei)影響江口(kou)蘿卜豬肉質(zhì)(zhi)性能的重(zhong)要SNPs位點(diǎn),且(qie)UCP3 基因表達(dá)量(liang)提高(gao)有利于肌內(nèi)(nei)脂肪的沉(chen)積,此研究結(jié)果(guo)為篩選有助(zhu)于江口蘿卜豬(zhu)肌內(nèi)(nei)脂肪(fang)沉積(ji)的分子(zi)標(biāo)記提(ti)供了參考依(yi)據(jù)。
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