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肌肉嫩度儀:江(jiang)口蘿卜(bo)豬UCP3 基因(yin)變異及其表達(da)量與肉質(zhì)性(xing)狀關(guān)聯(lián)(lian)性分析
? ?2018年,貴州大(da)學動(dong)物科學學院研究人員在國(guo)內(nèi)期(qi)刊《農(nóng)業(yè)(ye)生物技術(shù)(shu)學報》在線發(fā)表了(le)題為“江口蘿卜豬UCP3 基(ji)因變異及(ji)其表達(da)量與肉(rou)質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)性(xing)分析"的研究文章。在(zai)該論(lun)文中,研究(jiu)人員使(shi)用上(shang)海騰拔儀(yi)器科技有限公(gong)司的RTA-Meat肌肉嫩度(du)儀來測定豬肉(rou)的剪切(qie)力。
? 摘要(yao):解耦聯(lián)蛋白3 (uncoupling protein 3, UCP3)作(zuo)為重要調(diào)控(kong)蛋白,主(zhu)要參與機體能(neng)量代(dai)謝調(diào)節(jié),在脂質(zhì)(zhi)代謝,脂肪酸氧(yang)化和脂肪(fang)沉積中起(qi)著重(zhong)要作(zuo)用,對氧化磷(lin)酸化反(fan)應(yīng)途徑是(shi)否產(chǎn)生ATP起決(jue)定性作用。為(wei)研究UCP3 基(ji)因與豬肉(rou)質(zhì)性狀之間(jian)的關(guān)系,本研究(jiu)測定了165 頭江(jiang)口蘿卜豬(Sus scrofa) 11 項(xiang)肉質(zhì)性能指(zhi)標,利用混(hun)合DNA池擴(kuo)增UCP3 基因全部外(wai)顯子,測(ce)序篩選SNPs 位點(dian),用單個樣本DNA擴(kuo)增SNPs 位點對(dui)應(yīng)外(wai)顯子并測序,以(yi)驗證位點和(he)分型,分析(xi)各位點不(bu)同基因(yin)型江口蘿卜豬(zhu)肉質(zhì)性能差(cha)異。采用qRTPCR檢測了(le)UCP3 基因在背(bei)最長肌中的(de)表達(da)量,進行(xing)基因(yin)型、肉質(zhì)性能(neng)以及基因表達(da)量的相關(guān)性研(yan)究。研究結(jié)果(guo)發(fā)現(xiàn)了(le)6 個SNPs 位點,g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群體遺(yi)傳參數(shù)分(fen)析發(fā)(fa)現(xiàn)除(chu)g.10479A>G/T位點外的其他(ta)位點雜(za)合度(du)高,說明群體(ti)內(nèi)等位(wei)基因分布(bu)比較均勻;有(you)效等位(wei)基因數(shù)(shu)高,表明群體(ti)內(nèi)變異程度大(da);多態(tài)信息含(han)量均大(da)于0.25,為(wei)中度多態(tài),表(biao)明位(wei)點可以提(ti)供一定的(de)遺傳信息(xi)。χ2檢驗顯(xian)示6 個位(wei)點均極顯著(zhu)偏離Hardy-Weinberg 平衡(heng)。連鎖不平衡(heng)分析(xi)發(fā)現(xiàn)(xian),g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位(wei)點、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位點(dian)為*連鎖不平衡(heng),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間為強連(lian)鎖不平衡。SNPs 位點(dian)與肉(rou)質(zhì)的關(guān)聯(lián)(lian)性分析(xi)發(fā)現(xiàn)g.10479A>G/T位(wei)點TT型(xing)和GG型個體大理(li)石紋(wen)評分顯著(zhu)高于AA型和(he)AG型個體,剪切(qie)力則反之;基因(yin)型與(yu)背最長肌中(zhong)UCP3 基因表達量的(de)關(guān)聯(lián)性(xing)分析發(fā)現(xiàn)(xian),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T 4 個位點(dian)上均為突變(bian)型個體表(biao)達量極(ji)顯著高(gao)于另外兩種(zhong)基因型;UCP3 基(ji)因在(zai)背最(zui)長肌中的(de)表達量(liang)與兩項肉質(zhì)指(zhi)標存在極顯(xian)著相關(guān)性,其中(zhong)與剪切力負相(xiang)關(guān),與肌內(nèi)(nei)脂肪含量(liang)正相關(guān)。本(ben)研究結(jié)(jie)果表明,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及(ji)g.10479A>G/T位點為影(ying)響江(jiang)口蘿卜豬肉(rou)質(zhì)性能的重(zhong)要SNPs位(wei)點,且(qie)UCP3 基因表(biao)達量提高(gao)有利于肌(ji)內(nèi)脂肪的(de)沉積(ji),此研究結(jié)果(guo)為篩選有助于(yu)江口蘿卜豬(zhu)肌內(nèi)(nei)脂肪沉(chen)積的分子標(biao)記提供了參考(kao)依據(jù)(ju)。
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