技術文章(zhang)
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肌肉嫩度儀:江(jiang)口蘿卜(bo)豬UCP3 基因變(bian)異及其(qi)表達量與肉質(zhi)性狀關聯(lián)性分(fen)析
? ?2018年,貴州大學動物(wu)科學(xue)學院研究人員在國(guo)內(nèi)期刊(kan)《農(nóng)業(yè)生物技術(shu)學報(bao)》在線發(fā)表了題(ti)為“江口蘿卜豬(zhu)UCP3 基因變異及其(qi)表達量與肉(rou)質性狀(zhuang)關聯(lián)性分析"的研究文章。在(zai)該論文中(zhong),研究人員使用(yong)上海騰拔(ba)儀器(qi)科技有限公(gong)司的RTA-Meat肌肉嫩(nen)度儀來測定豬(zhu)肉的剪(jian)切力。
? 摘要:解耦(ou)聯(lián)蛋白3 (uncoupling protein 3, UCP3)作為重(zhong)要調(diào)控蛋白,主(zhu)要參(can)與機體能量代(dai)謝調(diào)(diao)節(jié),在脂質代(dai)謝,脂肪酸氧化(hua)和脂(zhi)肪沉積中起著(zhe)重要作用,對氧(yang)化磷酸化反(fan)應途(tu)徑是否產(chǎn)(chan)生ATP起決定性作(zuo)用。為研(yan)究UCP3 基因與豬(zhu)肉質性狀之間(jian)的關系,本研(yan)究測定(ding)了165 頭江口(kou)蘿卜(bo)豬(Sus scrofa) 11 項肉質(zhi)性能指標,利(li)用混合(he)DNA池擴增UCP3 基因(yin)全部外顯(xian)子,測序篩(shai)選SNPs 位點,用單個(ge)樣本DNA擴(kuo)增SNPs 位(wei)點對應(ying)外顯子(zi)并測序,以(yi)驗證位點和(he)分型,分析各(ge)位點(dian)不同基因型江(jiang)口蘿(luo)卜豬肉(rou)質性(xing)能差異。采(cai)用qRTPCR檢測了UCP3 基(ji)因在背最長肌(ji)中的(de)表達量,進行基(ji)因型、肉質(zhi)性能以(yi)及基因(yin)表達(da)量的相關性(xing)研究。研究結(jie)果發(fā)現(xiàn)了6 個(ge)SNPs 位點,g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群體遺(yi)傳參數(shù)分析(xi)發(fā)現(xiàn)除g.10479A>G/T位點(dian)外的其他(ta)位點雜合(he)度高,說明群(qun)體內(nèi)等位基因(yin)分布比較均勻(yun);有效等(deng)位基因數(shù)高(gao),表明群體內(nèi)(nei)變異程度(du)大;多態(tài)信息含(han)量均(jun)大于(yu)0.25,為中度(du)多態(tài),表明位點(dian)可以提供一(yi)定的遺傳信息(xi)。χ2檢驗顯示(shi)6 個位點均(jun)極顯(xian)著偏離(li)Hardy-Weinberg 平衡。連鎖不(bu)平衡分(fen)析發(fā)現(xiàn)(xian),g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位點、g. 10439C>T 和(he)g. 10466G>A 位點為*連鎖不(bu)平衡,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間(jian)為強連鎖不(bu)平衡。SNPs 位點(dian)與肉質的關聯(lián)(lian)性分析發(fā)現(xiàn)g.10479A>G/T位(wei)點TT型和(he)GG型個體大(da)理石紋評分顯(xian)著高(gao)于AA型和AG型個體(ti),剪切力則反之(zhi);基因型與背最(zui)長肌中UCP3 基因(yin)表達量的關(guan)聯(lián)性分析發(fā)現(xiàn)(xian),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T 4 個位點(dian)上均(jun)為突變型個(ge)體表(biao)達量極顯著高(gao)于另外兩種(zhong)基因型(xing);UCP3 基因(yin)在背最長(zhang)肌中的(de)表達量與(yu)兩項肉質指標(biao)存在極顯著相(xiang)關性,其中與剪(jian)切力負(fu)相關,與肌內(nèi)脂(zhi)肪含量正(zheng)相關。本研(yan)究結果(guo)表明,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以(yi)及g.10479A>G/T位點為(wei)影響(xiang)江口蘿(luo)卜豬肉質性(xing)能的重要(yao)SNPs位點,且UCP3 基(ji)因表達量提(ti)高有利于(yu)肌內(nèi)(nei)脂肪(fang)的沉積,此研(yan)究結果(guo)為篩選有助(zhu)于江口(kou)蘿卜豬肌內(nèi)(nei)脂肪沉積(ji)的分(fen)子標記提(ti)供了參考依(yi)據(jù)。
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