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肌肉嫩(nen)度儀:江(jiang)口蘿卜豬(zhu)UCP3 基因(yin)變異及其表達(dá)(da)量與肉質(zhì)(zhi)性狀關(guān)聯(lián)(lian)性分析
? ?2018年,貴州大(da)學(xué)動(dòng)物科(ke)學(xué)學(xué)(xue)院研究人員在國(guó)(guo)內(nèi)期刊(kan)《農(nóng)業(yè)生物(wu)技術(shù)學(xué)報(bào)(bao)》在線(xiàn)發(fā)表了(le)題為“江口蘿卜豬(zhu)UCP3 基因變異(yi)及其表達(dá)量與(yu)肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)(lian)性分析(xi)"的研究文章(zhang)。在該論(lun)文中,研究人員(yuan)使用上(shang)海騰(teng)拔儀器科(ke)技有限公司的(de)RTA-Meat肌肉(rou)嫩度儀來(lái)(lai)測(cè)定豬肉的剪(jian)切力。
? 摘要:解耦(ou)聯(lián)蛋白3 (uncoupling protein 3, UCP3)作(zuo)為重要調(diào)控(kong)蛋白,主(zhu)要參與機(jī)體能(neng)量代謝調(diào)節(jié),在(zai)脂質(zhì)(zhi)代謝,脂肪(fang)酸氧化和脂(zhi)肪沉(chen)積中(zhong)起著(zhe)重要作(zuo)用,對(duì)氧(yang)化磷酸化(hua)反應(yīng)途(tu)徑是(shi)否產(chǎn)(chan)生ATP起決定性作(zuo)用。為研究(jiu)UCP3 基因與豬(zhu)肉質(zhì)性狀之間(jian)的關(guān)系,本(ben)研究(jiu)測(cè)定了165 頭(tou)江口(kou)蘿卜豬(Sus scrofa) 11 項(xiàng)(xiang)肉質(zhì)性(xing)能指標(biāo),利用混(hun)合DNA池(chi)擴(kuò)增UCP3 基因(yin)全部(bu)外顯子,測(cè)序(xu)篩選SNPs 位點(diǎn),用單(dan)個(gè)樣本DNA擴(kuò)增SNPs 位(wei)點(diǎn)對(duì)應(yīng)外顯(xian)子并測(cè)序,以驗(yàn)(yan)證位(wei)點(diǎn)和分型,分(fen)析各位點(diǎn)不(bu)同基因型(xing)江口蘿卜豬肉(rou)質(zhì)性能差異。采(cai)用qRTPCR檢測(cè)(ce)了UCP3 基因在背最(zui)長(zhǎng)肌中的表達(dá)(da)量,進(jìn)行基因(yin)型、肉質(zhì)(zhi)性能以(yi)及基因表達(dá)(da)量的相關(guān)(guan)性研究。研究(jiu)結(jié)果發(fā)(fa)現(xiàn)了6 個(gè)SNPs 位點(diǎn)(dian),g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群體遺(yi)傳參數(shù)分析(xi)發(fā)現(xiàn)除(chu)g.10479A>G/T位點(diǎn)外的(de)其他位點(diǎn)(dian)雜合度高,說(shuō)明(ming)群體內(nèi)等位(wei)基因分布(bu)比較(jiao)均勻;有效等位(wei)基因數(shù)高,表(biao)明群體內(nèi)變(bian)異程度大;多(duo)態(tài)信息含(han)量均(jun)大于0.25,為(wei)中度多態(tài),表(biao)明位(wei)點(diǎn)可以提供(gong)一定(ding)的遺傳信息。χ2檢(jian)驗(yàn)顯示6 個(gè)位(wei)點(diǎn)均極顯(xian)著偏(pian)離Hardy-Weinberg 平衡。連鎖不(bu)平衡分析發(fā)現(xiàn)(xian),g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位點(diǎn)、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位(wei)點(diǎn)為*連鎖不平(ping)衡,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間為強(qiáng)(qiang)連鎖不平衡(heng)。SNPs 位點(diǎn)與肉質(zhì)(zhi)的關(guān)聯(lián)性分(fen)析發(fā)現(xiàn)g.10479A>G/T位(wei)點(diǎn)TT型和(he)GG型個(gè)體大(da)理石紋評(píng)分(fen)顯著(zhu)高于(yu)AA型和AG型個(gè)(ge)體,剪(jian)切力則(ze)反之;基因(yin)型與(yu)背最長(zhǎng)(zhang)肌中UCP3 基因(yin)表達(dá)量的(de)關(guān)聯(lián)性分(fen)析發(fā)現(xiàn),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以(yi)及g.10479A>G/T 4 個(gè)位點(diǎn)上均(jun)為突變型個(gè)體(ti)表達(dá)(da)量極顯著高于(yu)另外兩種基因(yin)型;UCP3 基因在(zai)背最長(zhǎng)(zhang)肌中的表達(dá)量(liang)與兩項(xiàng)(xiang)肉質(zhì)指標(biāo)存(cun)在極顯(xian)著相關(guān)性(xing),其中與(yu)剪切力(li)負(fù)相(xiang)關(guān),與肌內(nèi)(nei)脂肪含量正相(xiang)關(guān)。本(ben)研究(jiu)結(jié)果(guo)表明,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T位點(diǎn)(dian)為影響江口蘿(luo)卜豬(zhu)肉質(zhì)性(xing)能的重要(yao)SNPs位點(diǎn)(dian),且UCP3 基因表(biao)達(dá)量(liang)提高有利于(yu)肌內(nèi)(nei)脂肪的沉積(ji),此研究結(jié)(jie)果為篩(shai)選有助于(yu)江口蘿卜(bo)豬肌內(nèi)脂肪(fang)沉積的(de)分子標(biāo)記提(ti)供了參考依據(jù)(ju)。
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