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肌肉嫩(nen)度儀:江(jiang)口蘿卜豬(zhu)UCP3 基因(yin)變異及其表達(dá)(da)量與肉質(zhì)性狀(zhuang)關(guān)聯(lián)性分(fen)析
? ?2018年,貴州大學(xué)動(dòng)物(wu)科學(xué)(xue)學(xué)院(yuan)研究人員(yuan)在國(guó)內(nèi)期(qi)刊《農(nóng)業(yè)生物技(ji)術(shù)學(xué)報(bào)》在線發(fā)(fa)表了題為“江口(kou)蘿卜(bo)豬UCP3 基因(yin)變異及其(qi)表達(dá)(da)量與肉(rou)質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)(lian)性分(fen)析"的研究文(wen)章。在該論(lun)文中,研究人(ren)員使用(yong)上海騰拔儀(yi)器科(ke)技有(you)限公司的(de)RTA-Meat肌肉嫩度儀來(lái)(lai)測(cè)定豬(zhu)肉的剪切力。
? 摘要:解耦聯(lián)蛋(dan)白3 (uncoupling protein 3, UCP3)作(zuo)為重(zhong)要調(diào)控蛋白(bai),主要(yao)參與機(jī)體(ti)能量代謝調(diào)(diao)節(jié),在脂質(zhì)(zhi)代謝,脂肪(fang)酸氧化和脂(zhi)肪沉(chen)積中起著重(zhong)要作(zuo)用,對(duì)氧化磷酸(suan)化反應(yīng)途徑是(shi)否產(chǎn)生ATP起決定(ding)性作用。為研究(jiu)UCP3 基因與豬(zhu)肉質(zhì)性(xing)狀之間的(de)關(guān)系,本(ben)研究測(cè)定了165 頭(tou)江口蘿卜(bo)豬(Sus scrofa) 11 項(xiàng)(xiang)肉質(zhì)性(xing)能指標(biāo),利用(yong)混合DNA池?cái)U(kuò)(kuo)增UCP3 基因全部外(wai)顯子(zi),測(cè)序(xu)篩選SNPs 位點(diǎn),用(yong)單個(gè)樣本DNA擴(kuò)(kuo)增SNPs 位點(diǎn)對(duì)應(yīng)外(wai)顯子并測(cè)(ce)序,以驗(yàn)證(zheng)位點(diǎn)和分(fen)型,分(fen)析各(ge)位點(diǎn)不同基因(yin)型江口蘿(luo)卜豬肉質(zhì)性能(neng)差異。采用qRTPCR檢測(cè)(ce)了UCP3 基(ji)因在(zai)背最長(zhǎng)肌(ji)中的表達(dá)量(liang),進(jìn)行基(ji)因型、肉質(zhì)性(xing)能以及基因(yin)表達(dá)(da)量的相(xiang)關(guān)性研究。研究(jiu)結(jié)果(guo)發(fā)現(xiàn)(xian)了6 個(gè)(ge)SNPs 位點(diǎn),g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群體遺(yi)傳參數(shù)(shu)分析發(fā)現(xiàn)(xian)除g.10479A>G/T位(wei)點(diǎn)外的(de)其他位點(diǎn)(dian)雜合度高,說(shuō)(shuo)明群體(ti)內(nèi)等位(wei)基因(yin)分布比較(jiao)均勻(yun);有效等位基(ji)因數(shù)高,表明群(qun)體內(nèi)變異程度(du)大;多態(tài)(tai)信息含量均(jun)大于(yu)0.25,為中度多態(tài)(tai),表明(ming)位點(diǎn)可(ke)以提供一定(ding)的遺傳(chuan)信息。χ2檢(jian)驗(yàn)顯示(shi)6 個(gè)位點(diǎn)均極(ji)顯著偏(pian)離Hardy-Weinberg 平衡。連(lian)鎖不平衡(heng)分析(xi)發(fā)現(xiàn),g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位(wei)點(diǎn)、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位點(diǎn)為*連(lian)鎖不平衡,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間(jian)為強(qiáng)(qiang)連鎖不平衡(heng)。SNPs 位點(diǎn)與肉質(zhì)的(de)關(guān)聯(lián)性分析發(fā)(fa)現(xiàn)g.10479A>G/T位點(diǎn)TT型(xing)和GG型個(gè)體大(da)理石紋評(píng)分顯(xian)著高于AA型和(he)AG型個(gè)體,剪切力(li)則反之;基因(yin)型與背(bei)最長(zhǎng)肌(ji)中UCP3 基(ji)因表達(dá)(da)量的關(guān)聯(lián)(lian)性分析(xi)發(fā)現(xiàn),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T 4 個(gè)(ge)位點(diǎn)上均為突(tu)變型個(gè)體表達(dá)(da)量極顯著高(gao)于另外兩種(zhong)基因型;UCP3 基因(yin)在背最長(zhǎng)肌中(zhong)的表(biao)達(dá)量與兩項(xiàng)(xiang)肉質(zhì)(zhi)指標(biāo)存在極(ji)顯著相(xiang)關(guān)性,其(qi)中與剪切力(li)負(fù)相關(guān),與肌(ji)內(nèi)脂肪含量(liang)正相關(guān)。本研(yan)究結(jié)果表明,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以(yi)及g.10479A>G/T位點(diǎn)為影響(xiang)江口蘿(luo)卜豬肉質(zhì)(zhi)性能的重要SNPs位(wei)點(diǎn),且UCP3 基(ji)因表達(dá)(da)量提高有利于(yu)肌內(nèi)脂肪(fang)的沉積,此研究(jiu)結(jié)果為(wei)篩選(xuan)有助于江口(kou)蘿卜豬肌內(nèi)脂(zhi)肪沉積(ji)的分子標(biāo)(biao)記提供(gong)了參考依(yi)據(jù)。
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