技術(shù)(shu)文章(zhang)
Technical articles? ?2018年,貴州大(da)學(xué)動物科學(xué)(xue)學(xué)院(yuan)研究人員(yuan)在國內(nèi)期刊《農(nóng)業(yè)(ye)生物(wu)技術(shù)學(xué)報》在線(xian)發(fā)表(biao)了題為“江口蘿卜豬UCP3 基(ji)因變異(yi)及其表達(dá)量(liang)與肉質(zhì)性(xing)狀關(guān)聯(lián)性分析(xi)"的研究文(wen)章。在該(gai)論文中,研究人(ren)員使用上(shang)海騰拔儀器(qi)科技有限公(gong)司的RTA-Meat肌肉嫩度(du)儀來測定(ding)豬肉(rou)的剪切力(li)。
? 摘要:解耦聯(lián)(lian)蛋白3 (uncoupling protein 3, UCP3)作為(wei)重要調(diào)控蛋(dan)白,主要參與機(jī)(ji)體能量代謝調(diào)(diao)節(jié),在脂(zhi)質(zhì)代謝,脂肪酸(suan)氧化和脂肪(fang)沉積中起著重(zhong)要作用(yong),對氧化磷酸化(hua)反應(yīng)途徑(jing)是否(fou)產(chǎn)生ATP起決定性(xing)作用。為(wei)研究(jiu)UCP3 基因(yin)與豬肉質(zhì)性(xing)狀之間的關(guān)(guan)系,本研究測(ce)定了165 頭江(jiang)口蘿卜(bo)豬(Sus scrofa) 11 項(xiàng)肉質(zhì)性(xing)能指標(biāo),利(li)用混合DNA池(chi)擴(kuò)增UCP3 基(ji)因全(quan)部外顯(xian)子,測序篩選(xuan)SNPs 位點(diǎn),用單(dan)個樣本DNA擴(kuò)(kuo)增SNPs 位(wei)點(diǎn)對應(yīng)外顯(xian)子并測序,以(yi)驗(yàn)證位點(diǎn)(dian)和分型,分析各(ge)位點(diǎn)(dian)不同基因型(xing)江口蘿卜豬(zhu)肉質(zhì)(zhi)性能差異。采用(yong)qRTPCR檢測了UCP3 基(ji)因在(zai)背最長(zhang)肌中的表(biao)達(dá)量,進(jìn)行基(ji)因型、肉(rou)質(zhì)性能以(yi)及基因表達(dá)(da)量的相關(guān)性(xing)研究。研(yan)究結(jié)果發(fā)(fa)現(xiàn)了6 個SNPs 位點(diǎn)(dian),g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群體遺傳參(can)數(shù)分析(xi)發(fā)現(xiàn)除g.10479A>G/T位點(diǎn)(dian)外的其他位(wei)點(diǎn)雜合度(du)高,說明群體內(nèi)(nei)等位基(ji)因分布(bu)比較(jiao)均勻;有效(xiao)等位基因數(shù)(shu)高,表明群(qun)體內(nèi)(nei)變異程度大(da);多態(tài)信息(xi)含量均大于(yu)0.25,為中度多態(tài),表(biao)明位點(diǎn)可(ke)以提(ti)供一定的(de)遺傳信息。χ2檢(jian)驗(yàn)顯示6 個位點(diǎn)(dian)均極顯著(zhu)偏離(li)Hardy-Weinberg 平衡。連鎖不(bu)平衡(heng)分析發(fā)(fa)現(xiàn),g. 3127A>G 和(he)g. 3205T>C 位點(diǎn)、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位點(diǎn)為(wei)*連鎖不平衡(heng),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間為強(qiáng)連(lian)鎖不平衡。SNPs 位點(diǎn)(dian)與肉質(zhì)的關(guān)聯(lián)(lian)性分析發(fā)現(xiàn)(xian)g.10479A>G/T位點(diǎn)(dian)TT型和GG型(xing)個體大理石紋(wen)評分顯著(zhu)高于AA型和(he)AG型個體,剪切力(li)則反之;基因型(xing)與背最長(zhang)肌中(zhong)UCP3 基因(yin)表達(dá)量的關(guān)聯(lián)(lian)性分析(xi)發(fā)現(xiàn),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T 4 個位(wei)點(diǎn)上均為突變(bian)型個體表達(dá)(da)量極顯著高(gao)于另外兩種基(ji)因型;UCP3 基(ji)因在背(bei)最長肌(ji)中的表達(dá)量與(yu)兩項(xiàng)肉質(zhì)(zhi)指標(biāo)存(cun)在極顯著相(xiang)關(guān)性(xing),其中與(yu)剪切力負(fù)相(xiang)關(guān),與肌內(nèi)脂(zhi)肪含量正相關(guān)(guan)。本研究(jiu)結(jié)果表明,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及(ji)g.10479A>G/T位點(diǎn)為影響(xiang)江口蘿(luo)卜豬肉質(zhì)(zhi)性能的重要(yao)SNPs位點(diǎn),且(qie)UCP3 基因表達(dá)量提(ti)高有利于肌內(nèi)(nei)脂肪的沉積(ji),此研(yan)究結(jié)果(guo)為篩選有(you)助于(yu)江口蘿卜豬(zhu)肌內(nèi)脂肪(fang)沉積的(de)分子標(biāo)記(ji)提供了參(can)考依據(jù)。
全文下載鏈接(jie):江口(kou)蘿卜豬UCP3 基(ji)因變異(yi)及其表達(dá)量與(yu)肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)(lian)性分析(xi)