技術(shù)文章
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肌肉(rou)嫩度儀:江口蘿(luo)卜豬UCP3 基因變(bian)異及其表達(dá)量(liang)與肉(rou)質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)性(xing)分析
? ?2018年,貴州大學(xué)(xue)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院(yuan)研究(jiu)人員在國(guó)(guo)內(nèi)期刊(kan)《農(nóng)業(yè)生物(wu)技術(shù)(shu)學(xué)報(bào)(bao)》在線發(fā)(fa)表了(le)題為“江口(kou)蘿卜豬UCP3 基(ji)因變(bian)異及其表達(dá)(da)量與肉質(zhì)(zhi)性狀關(guān)聯(lián)性(xing)分析(xi)"的研究(jiu)文章(zhang)。在該論文中(zhong),研究(jiu)人員(yuan)使用上海騰拔(ba)儀器科技(ji)有限(xian)公司的RTA-Meat肌肉(rou)嫩度儀來(lái)(lai)測(cè)定(ding)豬肉的剪(jian)切力。
? 摘要(yao):解耦聯(lián)蛋(dan)白3 (uncoupling protein 3, UCP3)作為重(zhong)要調(diào)控蛋白,主(zhu)要參與機(jī)(ji)體能量(liang)代謝調(diào)節(jié),在脂(zhi)質(zhì)代(dai)謝,脂(zhi)肪酸氧化和脂(zhi)肪沉積中起著(zhe)重要作用(yong),對(duì)氧(yang)化磷(lin)酸化反應(yīng)途(tu)徑是否產(chǎn)生ATP起(qi)決定性作用(yong)。為研究(jiu)UCP3 基因與豬肉(rou)質(zhì)性狀之間(jian)的關(guān)系,本研(yan)究測(cè)定了165 頭江(jiang)口蘿(luo)卜豬(Sus scrofa) 11 項(xiàng)肉質(zhì)性(xing)能指標(biāo),利用(yong)混合(he)DNA池?cái)U(kuò)(kuo)增UCP3 基因全部外(wai)顯子,測(cè)(ce)序篩選(xuan)SNPs 位點(diǎn),用單個(gè)樣(yang)本DNA擴(kuò)增SNPs 位點(diǎn)對(duì)(dui)應(yīng)外顯子并(bing)測(cè)序,以驗(yàn)證(zheng)位點(diǎn)和分型(xing),分析各位點(diǎn)(dian)不同基(ji)因型(xing)江口蘿卜豬肉(rou)質(zhì)性能差(cha)異。采用qRTPCR檢測(cè)(ce)了UCP3 基因(yin)在背最長(zhǎng)肌中(zhong)的表(biao)達(dá)量(liang),進(jìn)行基(ji)因型、肉(rou)質(zhì)性能(neng)以及基(ji)因表達(dá)量的(de)相關(guān)性研究。研(yan)究結(jié)果(guo)發(fā)現(xiàn)了6 個(gè)SNPs 位點(diǎn)(dian),g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群體遺傳參數(shù)(shu)分析發(fā)(fa)現(xiàn)除g.10479A>G/T位(wei)點(diǎn)外的(de)其他位點(diǎn)雜(za)合度高(gao),說(shuō)明(ming)群體內(nèi)等位基(ji)因分布比(bi)較均勻;有效等(deng)位基因數(shù)高(gao),表明群體內(nèi)(nei)變異(yi)程度大(da);多態(tài)信息(xi)含量均(jun)大于0.25,為(wei)中度(du)多態(tài)(tai),表明位點(diǎn)可(ke)以提(ti)供一定的遺傳(chuan)信息。χ2檢驗(yàn)顯示(shi)6 個(gè)位點(diǎn)均極顯(xian)著偏離Hardy-Weinberg 平(ping)衡。連鎖不(bu)平衡分析發(fā)現(xiàn)(xian),g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位點(diǎn)、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位(wei)點(diǎn)為*連(lian)鎖不平衡,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之(zhi)間為強(qiáng)連鎖不(bu)平衡(heng)。SNPs 位點(diǎn)(dian)與肉(rou)質(zhì)的關(guān)聯(lián)性分(fen)析發(fā)現(xiàn)g.10479A>G/T位(wei)點(diǎn)TT型和GG型(xing)個(gè)體大(da)理石紋評(píng)分(fen)顯著高(gao)于AA型和AG型(xing)個(gè)體,剪切力(li)則反之;基因(yin)型與背最長(zhǎng)(zhang)肌中UCP3 基因(yin)表達(dá)(da)量的(de)關(guān)聯(lián)性(xing)分析發(fā)(fa)現(xiàn),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T 4 個(gè)位點(diǎn)(dian)上均為(wei)突變型個(gè)(ge)體表達(dá)量(liang)極顯著(zhu)高于另(ling)外兩種基(ji)因型;UCP3 基因在(zai)背最長(zhǎng)肌中(zhong)的表達(dá)量與(yu)兩項(xiàng)肉質(zhì)指(zhi)標(biāo)存在極(ji)顯著相關(guān)性(xing),其中與剪切力(li)負(fù)相關(guān),與肌內(nèi)(nei)脂肪含量正相(xiang)關(guān)。本研(yan)究結(jié)果表明,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以(yi)及g.10479A>G/T位點(diǎn)(dian)為影響(xiang)江口(kou)蘿卜豬肉質(zhì)性(xing)能的(de)重要SNPs位(wei)點(diǎn),且UCP3 基因表(biao)達(dá)量提高有(you)利于肌(ji)內(nèi)脂肪的沉(chen)積,此(ci)研究結(jié)果為篩(shai)選有助(zhu)于江口蘿卜豬(zhu)肌內(nèi)脂(zhi)肪沉積的分(fen)子標(biāo)記提供(gong)了參(can)考依(yi)據(jù)。