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肌肉嫩度(du)儀:江口蘿(luo)卜豬UCP3 基因變異(yi)及其表達(dá)(da)量與肉(rou)質(zhì)性狀關(guān)(guan)聯(lián)性分析
? ?2018年,貴州大學(xué)動(dòng)(dong)物科(ke)學(xué)學(xué)(xue)院研究人員在國(guó)(guo)內(nèi)期(qi)刊《農(nóng)業(yè)生物技術(shù)(shu)學(xué)報(bào)》在線(xian)發(fā)表了題(ti)為“江口蘿卜豬(zhu)UCP3 基因變(bian)異及其表達(dá)(da)量與肉質(zhì)性狀(zhuang)關(guān)聯(lián)性分析(xi)"的研究文(wen)章。在該論(lun)文中,研究(jiu)人員使用上(shang)海騰拔儀(yi)器科(ke)技有(you)限公司的RTA-Meat肌(ji)肉嫩(nen)度儀來(lái)測(cè)定(ding)豬肉(rou)的剪(jian)切力。
? 摘要:解耦聯(lián)蛋白(bai)3 (uncoupling protein 3, UCP3)作為重要(yao)調(diào)控(kong)蛋白(bai),主要參與機(jī)(ji)體能量代謝調(diào)(diao)節(jié),在脂(zhi)質(zhì)代謝(xie),脂肪酸(suan)氧化和(he)脂肪沉(chen)積中起(qi)著重要作用(yong),對(duì)氧化磷酸(suan)化反應(yīng)途徑是(shi)否產(chǎn)生ATP起決定(ding)性作用(yong)。為研(yan)究UCP3 基因(yin)與豬肉(rou)質(zhì)性狀之間(jian)的關(guān)系(xi),本研究測(cè)(ce)定了165 頭(tou)江口蘿卜豬(zhu)(Sus scrofa) 11 項(xiàng)肉質(zhì)性能指(zhi)標(biāo),利用(yong)混合(he)DNA池?cái)U(kuò)(kuo)增UCP3 基因全部(bu)外顯子,測(cè)序篩(shai)選SNPs 位點(diǎn)(dian),用單(dan)個(gè)樣本(ben)DNA擴(kuò)增SNPs 位點(diǎn)(dian)對(duì)應(yīng)外(wai)顯子并(bing)測(cè)序,以(yi)驗(yàn)證位點(diǎn)和分(fen)型,分析各位點(diǎn)(dian)不同基因型(xing)江口蘿卜(bo)豬肉質(zhì)性(xing)能差(cha)異。采用qRTPCR檢測(cè)(ce)了UCP3 基(ji)因在背最(zui)長(zhǎng)肌中的表(biao)達(dá)量(liang),進(jìn)行基因型(xing)、肉質(zhì)性(xing)能以及基因(yin)表達(dá)量的相(xiang)關(guān)性(xing)研究。研究(jiu)結(jié)果發(fā)現(xiàn)了6 個(gè)(ge)SNPs 位點(diǎn)(dian),g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群體遺(yi)傳參數(shù)分(fen)析發(fā)現(xiàn)除(chu)g.10479A>G/T位點(diǎn)外的其他(ta)位點(diǎn)雜合度(du)高,說(shuō)(shuo)明群體內(nèi)等(deng)位基因分(fen)布比較均勻;有(you)效等位基(ji)因數(shù)高,表明群(qun)體內(nèi)(nei)變異程度大;多(duo)態(tài)信息含量(liang)均大于0.25,為中(zhong)度多態(tài),表明位(wei)點(diǎn)可(ke)以提供一定(ding)的遺傳信(xin)息。χ2檢驗(yàn)顯(xian)示6 個(gè)(ge)位點(diǎn)均極顯(xian)著偏離Hardy-Weinberg 平(ping)衡。連(lian)鎖不平衡分析(xi)發(fā)現(xiàn),g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位點(diǎn)、g. 10439C>T 和(he)g. 10466G>A 位點(diǎn)為*連鎖(suo)不平衡(heng),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間(jian)為強(qiáng)連鎖不平(ping)衡。SNPs 位(wei)點(diǎn)與肉質(zhì)的(de)關(guān)聯(lián)性(xing)分析發(fā)(fa)現(xiàn)g.10479A>G/T位(wei)點(diǎn)TT型和GG型(xing)個(gè)體大理(li)石紋評(píng)(ping)分顯(xian)著高于AA型和(he)AG型個(gè)體(ti),剪切(qie)力則反之(zhi);基因型與背(bei)最長(zhǎng)(zhang)肌中UCP3 基(ji)因表(biao)達(dá)量(liang)的關(guān)聯(lián)性分(fen)析發(fā)(fa)現(xiàn),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以(yi)及g.10479A>G/T 4 個(gè)位點(diǎn)上(shang)均為(wei)突變型(xing)個(gè)體表達(dá)(da)量極顯著高(gao)于另外兩種基(ji)因型;UCP3 基因在(zai)背最長(zhǎng)肌中的(de)表達(dá)量與兩(liang)項(xiàng)肉質(zhì)指標(biāo)(biao)存在極(ji)顯著相關(guān)性,其(qi)中與(yu)剪切力負(fù)相關(guān)(guan),與肌內(nèi)(nei)脂肪含量(liang)正相關(guān)。本研究(jiu)結(jié)果表明,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以(yi)及g.10479A>G/T位點(diǎn)為影(ying)響江口蘿(luo)卜豬肉(rou)質(zhì)性能的重(zhong)要SNPs位點(diǎn),且(qie)UCP3 基因表(biao)達(dá)量提高有利(li)于肌內(nèi)(nei)脂肪的(de)沉積,此研究結(jié)(jie)果為篩選有(you)助于江(jiang)口蘿卜豬肌(ji)內(nèi)脂肪沉積(ji)的分子(zi)標(biāo)記提供了參(can)考依據(jù)。
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