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技術(shù)(shu)文章
肌肉嫩度儀(yi):江口(kou)蘿卜豬UCP3 基因(yin)變異(yi)及其表達(dá)(da)量與肉質(zhì)性(xing)狀關(guān)聯(lián)性分(fen)析
? ?2018年,貴州大學(xué)(xue)動(dòng)物科學(xué)(xue)學(xué)院(yuan)研究人員在國(guó)(guo)內(nèi)期刊《農(nóng)業(yè)生物(wu)技術(shù)學(xué)報(bào)(bao)》在線發(fā)表了(le)題為“江口蘿卜豬(zhu)UCP3 基因變異及其(qi)表達(dá)(da)量與(yu)肉質(zhì)性狀(zhuang)關(guān)聯(lián)性(xing)分析(xi)"的研究文(wen)章。在該(gai)論文中,研(yan)究人(ren)員使用(yong)上海騰拔儀(yi)器科技有限(xian)公司的RTA-Meat肌肉嫩(nen)度儀來(lái)測(cè)定豬(zhu)肉的剪切力(li)。
? 摘要:解耦聯(lián)蛋白(bai)3 (uncoupling protein 3, UCP3)作為重要調(diào)控(kong)蛋白,主要參與(yu)機(jī)體能量代謝(xie)調(diào)節(jié),在(zai)脂質(zhì)代謝,脂(zhi)肪酸(suan)氧化和脂肪沉(chen)積中起著(zhe)重要作用,對(duì)氧(yang)化磷酸化反應(yīng)(ying)途徑(jing)是否產(chǎn)生ATP起(qi)決定性作用(yong)。為研究UCP3 基因(yin)與豬(zhu)肉質(zhì)性狀(zhuang)之間(jian)的關(guān)系,本研究(jiu)測(cè)定了165 頭(tou)江口(kou)蘿卜豬(Sus scrofa) 11 項(xiàng)(xiang)肉質(zhì)(zhi)性能指標(biāo)(biao),利用混合DNA池(chi)擴(kuò)增UCP3 基(ji)因全(quan)部外顯子(zi),測(cè)序篩選SNPs 位點(diǎn)(dian),用單個(gè)樣本(ben)DNA擴(kuò)增SNPs 位點(diǎn)(dian)對(duì)應(yīng)(ying)外顯子并測(cè)(ce)序,以驗(yàn)(yan)證位點(diǎn)(dian)和分型,分析各(ge)位點(diǎn)不同基(ji)因型江(jiang)口蘿卜豬肉(rou)質(zhì)性(xing)能差(cha)異。采用qRTPCR檢測(cè)了(le)UCP3 基因在背最長(zhǎng)(zhang)肌中的表達(dá)(da)量,進(jìn)行基因(yin)型、肉質(zhì)性能(neng)以及基因(yin)表達(dá)量(liang)的相關(guān)性研(yan)究。研究結(jié)果發(fā)(fa)現(xiàn)了6 個(gè)SNPs 位點(diǎn),g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群(qun)體遺傳參(can)數(shù)分析發(fā)(fa)現(xiàn)除(chu)g.10479A>G/T位點(diǎn)外(wai)的其他位(wei)點(diǎn)雜合度(du)高,說(shuō)明群體內(nèi)(nei)等位(wei)基因分(fen)布比較均(jun)勻;有效等(deng)位基因數(shù)高,表(biao)明群體內(nèi)(nei)變異(yi)程度(du)大;多態(tài)信(xin)息含量均大(da)于0.25,為中(zhong)度多態(tài)(tai),表明(ming)位點(diǎn)可以提(ti)供一定的遺(yi)傳信息。χ2檢驗(yàn)(yan)顯示6 個(gè)位點(diǎn)均(jun)極顯著偏(pian)離Hardy-Weinberg 平衡。連鎖不(bu)平衡分析(xi)發(fā)現(xiàn),g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位點(diǎn)、g. 10439C>T 和(he)g. 10466G>A 位點(diǎn)(dian)為*連鎖(suo)不平衡,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間為(wei)強(qiáng)連鎖不平衡(heng)。SNPs 位點(diǎn)與(yu)肉質(zhì)的關(guān)聯(lián)性(xing)分析發(fā)(fa)現(xiàn)g.10479A>G/T位點(diǎn)TT型(xing)和GG型個(gè)體大理(li)石紋評(píng)分顯著(zhu)高于AA型和(he)AG型個(gè)(ge)體,剪切力(li)則反(fan)之;基因(yin)型與背(bei)最長(zhǎng)肌中UCP3 基因(yin)表達(dá)量的關(guān)聯(lián)(lian)性分析發(fā)現(xiàn)(xian),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及(ji)g.10479A>G/T 4 個(gè)位點(diǎn)上均為(wei)突變型個(gè)(ge)體表達(dá)(da)量極顯著(zhu)高于另外兩(liang)種基因型(xing);UCP3 基因在背(bei)最長(zhǎng)肌中(zhong)的表達(dá)量(liang)與兩項(xiàng)肉質(zhì)指(zhi)標(biāo)存在極顯(xian)著相關(guān)性,其(qi)中與剪切力負(fù)(fu)相關(guān),與肌(ji)內(nèi)脂肪含(han)量正相(xiang)關(guān)。本研究結(jié)果(guo)表明,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T位(wei)點(diǎn)為影響(xiang)江口(kou)蘿卜豬(zhu)肉質(zhì)性能(neng)的重要SNPs位(wei)點(diǎn),且UCP3 基(ji)因表達(dá)量(liang)提高(gao)有利于(yu)肌內(nèi)脂肪的(de)沉積,此(ci)研究結(jié)果(guo)為篩選有助(zhu)于江(jiang)口蘿卜(bo)豬肌內(nèi)(nei)脂肪(fang)沉積的分(fen)子標(biāo)記提供了(le)參考依據(jù)。