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技術(shù)文章(zhang)
肌肉嫩度儀:江(jiang)口蘿卜豬UCP3 基因(yin)變異(yi)及其表(biao)達(dá)量與(yu)肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)(lian)性分析
? ?2018年,貴州大(da)學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)(xue)院研究人(ren)員在國(guó)(guo)內(nèi)期刊《農(nóng)業(yè)生物技(ji)術(shù)學(xué)報(bào)(bao)》在線發(fā)(fa)表了題為“江口蘿卜(bo)豬UCP3 基因變異及(ji)其表(biao)達(dá)量與(yu)肉質(zhì)性(xing)狀關(guān)(guan)聯(lián)性分析"的研究文章(zhang)。在該論文(wen)中,研究人員使(shi)用上(shang)海騰拔(ba)儀器科(ke)技有(you)限公司的(de)RTA-Meat肌肉嫩(nen)度儀(yi)來(lái)測(cè)定(ding)豬肉的剪切力(li)。
? 摘要:解耦聯(lián)蛋白(bai)3 (uncoupling protein 3, UCP3)作為重要(yao)調(diào)控蛋白,主要(yao)參與(yu)機(jī)體能量(liang)代謝調(diào)節(jié),在(zai)脂質(zhì)代(dai)謝,脂(zhi)肪酸(suan)氧化和(he)脂肪沉積中起(qi)著重要作(zuo)用,對(duì)氧化磷(lin)酸化反(fan)應(yīng)途徑是否產(chǎn)(chan)生ATP起決(jue)定性作用(yong)。為研(yan)究UCP3 基因(yin)與豬肉質(zhì)(zhi)性狀之(zhi)間的關(guān)系,本研(yan)究測(cè)定了(le)165 頭江口(kou)蘿卜豬(Sus scrofa) 11 項(xiàng)肉(rou)質(zhì)性能指(zhi)標(biāo),利用混(hun)合DNA池?cái)U(kuò)增(zeng)UCP3 基因全部外顯(xian)子,測(cè)(ce)序篩選SNPs 位點(diǎn)(dian),用單個(gè)樣本(ben)DNA擴(kuò)增SNPs 位點(diǎn)對(duì)應(yīng)(ying)外顯子(zi)并測(cè)序(xu),以驗(yàn)(yan)證位點(diǎn)和(he)分型,分析(xi)各位(wei)點(diǎn)不同基因(yin)型江口蘿(luo)卜豬肉質(zhì)性(xing)能差異。采用(yong)qRTPCR檢測(cè)了(le)UCP3 基因(yin)在背最(zui)長(zhǎng)肌中(zhong)的表達(dá)量(liang),進(jìn)行基因型(xing)、肉質(zhì)(zhi)性能以及(ji)基因表(biao)達(dá)量(liang)的相(xiang)關(guān)性研(yan)究。研究結(jié)(jie)果發(fā)(fa)現(xiàn)了6 個(gè)SNPs 位(wei)點(diǎn),g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群體遺傳(chuan)參數(shù)分析發(fā)(fa)現(xiàn)除g.10479A>G/T位點(diǎn)外的(de)其他位(wei)點(diǎn)雜合度(du)高,說(shuō)明(ming)群體內(nèi)等(deng)位基因分布比(bi)較均(jun)勻;有效(xiao)等位基(ji)因數(shù)(shu)高,表明群體內(nèi)(nei)變異(yi)程度大(da);多態(tài)信息含(han)量均大于0.25,為(wei)中度多態(tài)(tai),表明位(wei)點(diǎn)可以提供一(yi)定的遺傳信(xin)息。χ2檢(jian)驗(yàn)顯(xian)示6 個(gè)位點(diǎn)(dian)均極顯(xian)著偏離Hardy-Weinberg 平衡(heng)。連鎖(suo)不平衡分析(xi)發(fā)現(xiàn),g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位(wei)點(diǎn)、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位點(diǎn)為(wei)*連鎖(suo)不平(ping)衡,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間為(wei)強(qiáng)連鎖(suo)不平衡(heng)。SNPs 位點(diǎn)與(yu)肉質(zhì)的關(guān)聯(lián)(lian)性分(fen)析發(fā)現(xiàn)g.10479A>G/T位點(diǎn)(dian)TT型和GG型個(gè)體大(da)理石紋(wen)評(píng)分顯著高于(yu)AA型和AG型個(gè)體(ti),剪切力則反(fan)之;基因(yin)型與(yu)背最長(zhǎng)肌中UCP3 基(ji)因表達(dá)量的(de)關(guān)聯(lián)性分析發(fā)(fa)現(xiàn),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以(yi)及g.10479A>G/T 4 個(gè)位(wei)點(diǎn)上均為(wei)突變型個(gè)體表(biao)達(dá)量極顯著高(gao)于另外兩(liang)種基因型(xing);UCP3 基因在(zai)背最長(zhǎng)肌中(zhong)的表達(dá)量與兩(liang)項(xiàng)肉質(zhì)(zhi)指標(biāo)存(cun)在極顯著相關(guān)(guan)性,其中與剪切(qie)力負(fù)相關(guān),與肌(ji)內(nèi)脂(zhi)肪含量(liang)正相關(guān)。本研(yan)究結(jié)果(guo)表明,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T位(wei)點(diǎn)為影響(xiang)江口(kou)蘿卜豬肉(rou)質(zhì)性(xing)能的重要SNPs位點(diǎn)(dian),且UCP3 基因表(biao)達(dá)量提高(gao)有利(li)于肌內(nèi)脂肪(fang)的沉積,此(ci)研究結(jié)(jie)果為篩選有(you)助于江口蘿(luo)卜豬肌內(nèi)脂(zhi)肪沉積的(de)分子標(biāo)記提供(gong)了參考依(yi)據(jù)。