技術文章(zhang)
Technical articles? ?2018年,貴州大學動物(wu)科學學院(yuan)研究人員在(zai)國內期刊《農業(yè)生(sheng)物技術學(xue)報》在線發(fā)表了題(ti)為“江口蘿卜豬(zhu)UCP3 基因變異(yi)及其表(biao)達量與(yu)肉質性狀關(guan)聯(lián)性分析"的研究文(wen)章。在該論(lun)文中,研究人(ren)員使(shi)用上海騰拔(ba)儀器科技有限(xian)公司的(de)RTA-Meat肌肉嫩度(du)儀來測定(ding)豬肉的剪切力(li)。
? 摘要:解耦聯(lián)蛋白3 (uncoupling protein 3, UCP3)作(zuo)為重(zhong)要調控蛋白(bai),主要參與機(ji)體能量代謝調(diao)節(jié),在(zai)脂質代(dai)謝,脂肪(fang)酸氧化和脂(zhi)肪沉積(ji)中起(qi)著重要作用(yong),對氧(yang)化磷酸(suan)化反應(ying)途徑是否(fou)產生(sheng)ATP起決定(ding)性作用(yong)。為研究UCP3 基(ji)因與豬肉質(zhi)性狀(zhuang)之間(jian)的關系,本(ben)研究測(ce)定了(le)165 頭江(jiang)口蘿(luo)卜豬(zhu)(Sus scrofa) 11 項肉質性(xing)能指標,利用(yong)混合DNA池擴(kuo)增UCP3 基因(yin)全部外顯(xian)子,測(ce)序篩(shai)選SNPs 位(wei)點,用單個樣(yang)本DNA擴(kuo)增SNPs 位點對應(ying)外顯子并測(ce)序,以驗證(zheng)位點和分型,分(fen)析各位點不同(tong)基因型江口蘿(luo)卜豬肉質性(xing)能差異。采用qRTPCR檢(jian)測了UCP3 基因在背(bei)最長肌中的表(biao)達量(liang),進行(xing)基因型、肉質(zhi)性能(neng)以及基因(yin)表達量的相(xiang)關性(xing)研究(jiu)。研究(jiu)結果發(fā)現(xiàn)了6 個(ge)SNPs 位點,g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群體遺傳(chuan)參數(shù)(shu)分析發(fā)現(xiàn)除(chu)g.10479A>G/T位點外的其他(ta)位點雜(za)合度高,說(shuo)明群體內(nei)等位(wei)基因(yin)分布比(bi)較均勻;有效等(deng)位基因(yin)數(shù)高,表明群(qun)體內變(bian)異程度大(da);多態(tài)信息(xi)含量均大于0.25,為(wei)中度多態(tài)(tai),表明(ming)位點可以(yi)提供(gong)一定的遺(yi)傳信(xin)息。χ2檢驗顯示6 個(ge)位點均極顯(xian)著偏離Hardy-Weinberg 平衡(heng)。連鎖不平衡分(fen)析發(fā)(fa)現(xiàn),g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位(wei)點、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位點(dian)為*連鎖(suo)不平衡,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之(zhi)間為強連鎖(suo)不平衡。SNPs 位(wei)點與肉質(zhi)的關(guan)聯(lián)性(xing)分析發(fā)現(xiàn)g.10479A>G/T位(wei)點TT型和GG型(xing)個體大理石紋(wen)評分顯著(zhu)高于AA型和AG型個(ge)體,剪切力(li)則反之;基因(yin)型與背最長(zhang)肌中UCP3 基因(yin)表達量的關聯(lián)(lian)性分析(xi)發(fā)現(xiàn),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T 4 個(ge)位點上均為突(tu)變型(xing)個體表(biao)達量極(ji)顯著(zhu)高于另外兩種(zhong)基因(yin)型;UCP3 基因在(zai)背最(zui)長肌(ji)中的表(biao)達量(liang)與兩項肉質(zhi)指標存(cun)在極顯(xian)著相關(guan)性,其中(zhong)與剪(jian)切力負相關(guan),與肌內(nei)脂肪含量正相(xiang)關。本研究結果(guo)表明,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T位(wei)點為影響江(jiang)口蘿卜豬肉(rou)質性能的(de)重要SNPs位點,且(qie)UCP3 基因表(biao)達量提高(gao)有利于肌內(nei)脂肪的沉積,此(ci)研究結(jie)果為篩選有助(zhu)于江口蘿(luo)卜豬肌內脂肪(fang)沉積的分子(zi)標記提供了參(can)考依據(jù)(ju)。
全文下載(zai)鏈接(jie):江口(kou)蘿卜豬UCP3 基因(yin)變異及(ji)其表達量與肉(rou)質性狀關聯(lián)性(xing)分析