技術(shù)文章
Technical articles? ?2018年,貴州(zhou)大學(xué)動(dòng)(dong)物科學(xué)學(xué)院(yuan)研究人員在國(guó)(guo)內(nèi)期刊《農(nóng)業(yè)(ye)生物技術(shù)(shu)學(xué)報(bào)》在線發(fā)(fa)表了題為“江口(kou)蘿卜(bo)豬UCP3 基因變異及(ji)其表達(dá)量與(yu)肉質(zhì)性狀(zhuang)關(guān)聯(lián)性分析(xi)"的研究文章(zhang)。在該論文中,研(yan)究人員使用上(shang)海騰拔儀器(qi)科技有限公(gong)司的RTA-Meat肌肉(rou)嫩度儀(yi)來(lái)測(cè)(ce)定豬肉的剪(jian)切力。
? 摘要:解耦聯(lián)蛋(dan)白3 (uncoupling protein 3, UCP3)作(zuo)為重(zhong)要調(diào)控蛋白(bai),主要參(can)與機(jī)(ji)體能量(liang)代謝調(diào)節(jié),在脂(zhi)質(zhì)代謝,脂肪酸(suan)氧化(hua)和脂肪(fang)沉積中(zhong)起著重要(yao)作用,對(duì)氧(yang)化磷酸化反(fan)應(yīng)途徑是否產(chǎn)(chan)生ATP起決定性作(zuo)用。為研(yan)究UCP3 基因與豬肉(rou)質(zhì)性狀之間(jian)的關(guān)系,本研究(jiu)測(cè)定了165 頭(tou)江口蘿卜豬(Sus scrofa) 11 項(xiàng)(xiang)肉質(zhì)性(xing)能指標(biāo)(biao),利用(yong)混合(he)DNA池?cái)U(kuò)增(zeng)UCP3 基因全部外(wai)顯子,測(cè)序篩(shai)選SNPs 位(wei)點(diǎn),用單(dan)個(gè)樣(yang)本DNA擴(kuò)增SNPs 位點(diǎn)對(duì)(dui)應(yīng)外(wai)顯子并測(cè)序,以(yi)驗(yàn)證位(wei)點(diǎn)和分型(xing),分析(xi)各位點(diǎn)不同(tong)基因(yin)型江口(kou)蘿卜(bo)豬肉(rou)質(zhì)性(xing)能差異。采用qRTPCR檢(jian)測(cè)了UCP3 基因(yin)在背最長(zhǎng)(zhang)肌中的表(biao)達(dá)量,進(jìn)(jin)行基因型、肉(rou)質(zhì)性(xing)能以及基(ji)因表達(dá)量的相(xiang)關(guān)性(xing)研究。研究(jiu)結(jié)果發(fā)(fa)現(xiàn)了6 個(gè)SNPs 位點(diǎn),g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群(qun)體遺傳參(can)數(shù)分析(xi)發(fā)現(xiàn)除g.10479A>G/T位點(diǎn)(dian)外的其他(ta)位點(diǎn)雜合(he)度高,說(shuō)明群(qun)體內(nèi)等位基(ji)因分布比較(jiao)均勻;有效等(deng)位基因(yin)數(shù)高(gao),表明群體內(nèi)變(bian)異程度大;多態(tài)(tai)信息含量均(jun)大于0.25,為中(zhong)度多態(tài),表(biao)明位點(diǎn)可以提(ti)供一定的遺(yi)傳信息。χ2檢驗(yàn)(yan)顯示(shi)6 個(gè)位點(diǎn)均極(ji)顯著(zhu)偏離Hardy-Weinberg 平衡。連(lian)鎖不平衡(heng)分析發(fā)現(xiàn),g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位(wei)點(diǎn)、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位點(diǎn)為*連(lian)鎖不(bu)平衡,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間(jian)為強(qiáng)連(lian)鎖不平衡(heng)。SNPs 位點(diǎn)與(yu)肉質(zhì)的(de)關(guān)聯(lián)性(xing)分析發(fā)現(xiàn)g.10479A>G/T位點(diǎn)(dian)TT型和GG型個(gè)體大(da)理石紋評(píng)分顯(xian)著高于AA型和(he)AG型個(gè)體,剪(jian)切力則反之(zhi);基因型(xing)與背最長(zhǎng)(zhang)肌中UCP3 基因(yin)表達(dá)量的關(guān)聯(lián)(lian)性分析發(fā)現(xiàn)(xian),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T 4 個(gè)(ge)位點(diǎn)上均(jun)為突變型個(gè)體(ti)表達(dá)量極(ji)顯著高于另外(wai)兩種基因(yin)型;UCP3 基因在背最(zui)長(zhǎng)肌中的表達(dá)(da)量與(yu)兩項(xiàng)肉(rou)質(zhì)指標(biāo)存在(zai)極顯(xian)著相關(guān)性,其(qi)中與(yu)剪切力負(fù)(fu)相關(guān),與肌(ji)內(nèi)脂(zhi)肪含量(liang)正相關(guān)。本研究(jiu)結(jié)果表明(ming),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T位點(diǎn)(dian)為影響江口蘿(luo)卜豬(zhu)肉質(zhì)性能的(de)重要SNPs位點(diǎn),且UCP3 基(ji)因表達(dá)量(liang)提高有利于肌(ji)內(nèi)脂肪的沉(chen)積,此研究結(jié)果(guo)為篩選有助(zhu)于江口(kou)蘿卜(bo)豬肌內(nèi)脂(zhi)肪沉積(ji)的分子標(biāo)記提(ti)供了參考(kao)依據(jù)。
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