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肌肉(rou)嫩度儀:江口(kou)蘿卜豬UCP3 基因(yin)變異及其(qi)表達(dá)量(liang)與肉質(zhì)性狀關(guān)(guan)聯(lián)性分析(xi)
? ?2018年,貴州大學(xué)(xue)動(dòng)物(wu)科學(xué)學(xué)院(yuan)研究人(ren)員在國(guó)內(nèi)期刊(kan)《農(nóng)業(yè)(ye)生物(wu)技術(shù)學(xué)報(bào)》在線發(fā)表(biao)了題為“江口蘿卜豬UCP3 基(ji)因變異及(ji)其表(biao)達(dá)量與肉(rou)質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)(lian)性分析"的研究文章。在(zai)該論文中,研(yan)究人員(yuan)使用(yong)上海(hai)騰拔儀器(qi)科技有限公(gong)司的(de)RTA-Meat肌肉嫩度儀來(lai)測(cè)定豬(zhu)肉的剪切力。
? 摘要:解耦聯(lián)(lian)蛋白3 (uncoupling protein 3, UCP3)作為重(zhong)要調(diào)控蛋(dan)白,主(zhu)要參與機(jī)體能(neng)量代謝(xie)調(diào)節(jié),在(zai)脂質(zhì)代(dai)謝,脂肪酸(suan)氧化(hua)和脂肪沉積中(zhong)起著(zhe)重要(yao)作用(yong),對(duì)氧(yang)化磷酸化反應(yīng)(ying)途徑是否(fou)產(chǎn)生ATP起決定(ding)性作用。為(wei)研究UCP3 基因(yin)與豬肉(rou)質(zhì)性狀之間的(de)關(guān)系,本(ben)研究(jiu)測(cè)定了(le)165 頭江口蘿卜豬(zhu)(Sus scrofa) 11 項(xiàng)肉(rou)質(zhì)性能指標(biāo),利(li)用混合(he)DNA池?cái)U(kuò)增UCP3 基(ji)因全(quan)部外顯子,測(cè)序(xu)篩選SNPs 位點(diǎn)(dian),用單個(gè)樣本DNA擴(kuò)(kuo)增SNPs 位點(diǎn)對(duì)應(yīng)(ying)外顯子并測(cè)序(xu),以驗(yàn)證位點(diǎn)(dian)和分型,分析各(ge)位點(diǎn)不(bu)同基因型江(jiang)口蘿卜(bo)豬肉(rou)質(zhì)性(xing)能差異。采(cai)用qRTPCR檢測(cè)(ce)了UCP3 基因(yin)在背最長(zhǎng)(zhang)肌中的表(biao)達(dá)量,進(jìn)行(xing)基因(yin)型、肉質(zhì)(zhi)性能以及(ji)基因表達(dá)量的(de)相關(guān)(guan)性研究(jiu)。研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)(xian)了6 個(gè)SNPs 位點(diǎn),g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群(qun)體遺傳參數(shù)分(fen)析發(fā)現(xiàn)(xian)除g.10479A>G/T位點(diǎn)外(wai)的其他(ta)位點(diǎn)(dian)雜合(he)度高(gao),說明群(qun)體內(nèi)等位基因(yin)分布比較均(jun)勻;有效(xiao)等位基(ji)因數(shù)高,表(biao)明群體(ti)內(nèi)變異(yi)程度大(da);多態(tài)信息含(han)量均(jun)大于(yu)0.25,為中(zhong)度多(duo)態(tài),表明位點(diǎn)(dian)可以(yi)提供一定(ding)的遺傳信息(xi)。χ2檢驗(yàn)顯(xian)示6 個(gè)位(wei)點(diǎn)均極顯(xian)著偏(pian)離Hardy-Weinberg 平(ping)衡。連鎖(suo)不平衡分析發(fā)(fa)現(xiàn),g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位點(diǎn)(dian)、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位點(diǎn)為*連(lian)鎖不平衡,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間(jian)為強(qiáng)連鎖(suo)不平衡。SNPs 位點(diǎn)與(yu)肉質(zhì)的關(guān)(guan)聯(lián)性分析(xi)發(fā)現(xiàn)g.10479A>G/T位點(diǎn)(dian)TT型和GG型個(gè)體大(da)理石紋評(píng)分(fen)顯著高于(yu)AA型和(he)AG型個(gè)體,剪(jian)切力則反(fan)之;基(ji)因型與背最(zui)長(zhǎng)肌中(zhong)UCP3 基因表達(dá)(da)量的(de)關(guān)聯(lián)性分析(xi)發(fā)現(xiàn)(xian),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及(ji)g.10479A>G/T 4 個(gè)位點(diǎn)(dian)上均為突變型(xing)個(gè)體表達(dá)量極(ji)顯著高(gao)于另外兩種(zhong)基因(yin)型;UCP3 基因在背(bei)最長(zhǎng)肌(ji)中的表達(dá)量(liang)與兩項(xiàng)肉質(zhì)指(zhi)標(biāo)存在極(ji)顯著(zhu)相關(guān)性,其(qi)中與剪切(qie)力負(fù)相(xiang)關(guān),與(yu)肌內(nèi)脂(zhi)肪含量正相(xiang)關(guān)。本研(yan)究結(jié)果表(biao)明,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T位點(diǎn)(dian)為影響江(jiang)口蘿卜豬肉(rou)質(zhì)性能的重要(yao)SNPs位點(diǎn),且UCP3 基因表(biao)達(dá)量提高(gao)有利于肌內(nèi)(nei)脂肪的沉積(ji),此研究(jiu)結(jié)果(guo)為篩(shai)選有助于江(jiang)口蘿(luo)卜豬(zhu)肌內(nèi)脂(zhi)肪沉積的分(fen)子標(biāo)記提供(gong)了參考依(yi)據(jù)。
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