技術(shù)文章
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肌肉嫩度儀:江(jiang)口蘿卜(bo)豬UCP3 基因(yin)變異及其(qi)表達(dá)量(liang)與肉質(zhì)(zhi)性狀關(guān)聯(lián)性分(fen)析
? ?2018年,貴州大學(xué)動(dòng)物(wu)科學(xué)學(xué)(xue)院研究人員在國(guó)(guo)內(nèi)期刊《農(nóng)業(yè)生(sheng)物技(ji)術(shù)學(xué)報(bào)》在線發(fā)表了(le)題為“江口蘿卜(bo)豬UCP3 基因變異(yi)及其表達(dá)(da)量與肉質(zhì)性(xing)狀關(guān)聯(lián)(lian)性分(fen)析"的研究文章(zhang)。在該論(lun)文中,研究人員(yuan)使用上海(hai)騰拔儀器科技(ji)有限公(gong)司的(de)RTA-Meat肌肉(rou)嫩度儀來(lái)測(cè)定(ding)豬肉的剪(jian)切力。
? 摘要:解耦聯(lián)(lian)蛋白3 (uncoupling protein 3, UCP3)作為(wei)重要調(diào)控蛋(dan)白,主要參(can)與機(jī)體(ti)能量代謝調(diào)(diao)節(jié),在(zai)脂質(zhì)代謝(xie),脂肪(fang)酸氧化和脂肪(fang)沉積中起(qi)著重要(yao)作用,對(duì)氧(yang)化磷酸化反應(yīng)(ying)途徑是否產(chǎn)(chan)生ATP起決(jue)定性作(zuo)用。為(wei)研究(jiu)UCP3 基因與豬肉質(zhì)(zhi)性狀之(zhi)間的關(guān)系(xi),本研(yan)究測(cè)(ce)定了165 頭江口蘿(luo)卜豬(Sus scrofa) 11 項(xiàng)肉質(zhì)性(xing)能指標(biāo),利用混(hun)合DNA池?cái)U(kuò)增(zeng)UCP3 基因全部外(wai)顯子,測(cè)序篩(shai)選SNPs 位點(diǎn)(dian),用單個(gè)樣(yang)本DNA擴(kuò)增(zeng)SNPs 位點(diǎn)對(duì)應(yīng)外(wai)顯子并測(cè)序,以(yi)驗(yàn)證位點(diǎn)(dian)和分型,分析各(ge)位點(diǎn)不同基因(yin)型江口蘿(luo)卜豬肉質(zhì)(zhi)性能差異。采用(yong)qRTPCR檢測(cè)(ce)了UCP3 基因在(zai)背最長(zhǎng)(zhang)肌中的表(biao)達(dá)量(liang),進(jìn)行基(ji)因型、肉(rou)質(zhì)性能以及(ji)基因表達(dá)量(liang)的相(xiang)關(guān)性研究。研(yan)究結(jié)果(guo)發(fā)現(xiàn)了6 個(gè)SNPs 位點(diǎn)(dian),g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群體遺傳(chuan)參數(shù)(shu)分析發(fā)(fa)現(xiàn)除(chu)g.10479A>G/T位點(diǎn)外的(de)其他位點(diǎn)(dian)雜合度高(gao),說(shuō)明群體內(nèi)(nei)等位基因分布(bu)比較均(jun)勻;有效等位(wei)基因數(shù)高,表(biao)明群體(ti)內(nèi)變異程度(du)大;多態(tài)信(xin)息含量均大(da)于0.25,為(wei)中度多態(tài),表(biao)明位點(diǎn)可以(yi)提供一定的(de)遺傳(chuan)信息。χ2檢驗(yàn)顯(xian)示6 個(gè)位點(diǎn)(dian)均極顯著偏離(li)Hardy-Weinberg 平衡。連(lian)鎖不平衡(heng)分析發(fā)現(xiàn),g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位(wei)點(diǎn)、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位點(diǎn)為*連(lian)鎖不平衡(heng),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間為強(qiáng)連(lian)鎖不平衡。SNPs 位(wei)點(diǎn)與肉質(zhì)(zhi)的關(guān)聯(lián)性分(fen)析發(fā)現(xiàn)g.10479A>G/T位點(diǎn)TT型(xing)和GG型(xing)個(gè)體(ti)大理(li)石紋(wen)評(píng)分(fen)顯著高于(yu)AA型和(he)AG型個(gè)(ge)體,剪切力(li)則反之(zhi);基因型與(yu)背最長(zhǎng)肌中(zhong)UCP3 基因表達(dá)(da)量的關(guān)聯(lián)性(xing)分析發(fā)(fa)現(xiàn),g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T 4 個(gè)位(wei)點(diǎn)上均為突(tu)變型個(gè)體表達(dá)(da)量極顯著高(gao)于另外(wai)兩種基(ji)因型;UCP3 基因(yin)在背最長(zhǎng)(zhang)肌中(zhong)的表達(dá)(da)量與兩項(xiàng)肉質(zhì)(zhi)指標(biāo)存在極顯(xian)著相關(guān)(guan)性,其中與(yu)剪切力(li)負(fù)相(xiang)關(guān),與肌內(nèi)脂肪(fang)含量正(zheng)相關(guān)。本研究結(jié)(jie)果表明,g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以(yi)及g.10479A>G/T位點(diǎn)(dian)為影(ying)響江口蘿卜豬(zhu)肉質(zhì)性能(neng)的重(zhong)要SNPs位點(diǎn),且UCP3 基因(yin)表達(dá)量提(ti)高有利于(yu)肌內(nèi)(nei)脂肪的沉積(ji),此研究結(jié)果為(wei)篩選有(you)助于江口蘿(luo)卜豬肌內(nèi)脂(zhi)肪沉(chen)積的(de)分子標(biāo)記提供(gong)了參考依(yi)據(jù)。
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